过滤程序

一个C写的过滤程序，遇到的问题有:

1. 没有装libboost1.42

2. exit没有进行定义

安装libboost（竟然和boost是一样的？！），方法：

1. ./bootstrap.sh --prefix=*/bin/boost_1_42_0/ --exec-prefix=*/bin/boost_1_42_0/

2. ./bjam install

修改编译程序：

CC = g++ 

 BOOST_INCLUDE =*/bin/boost_1_42_0/include/
 BOOST_LIB = */bin/boost_1_42_0/lib/


targets = ./filter_fq


all: $(targets)



./filter_fq: readsinfo.cpp filter_adapter.cpp filter_small_size.cpp trim_reads.cpp GEt_Gnum.cpp filter_fq.cpp adapterlist.h
	$(CC) -I $(BOOST_INCLUDE) -L $(BOOST_LIB) -l boost_iostreams -Wl,-rpath -Wl,*/bin/boost_1_42_0/lib/ $^ -o $@


clean:
	rm -f $(targets) 2> /dev/null

exit没有定义，在相应的cpp文件里最前面，写入：

#include <cstdlib>