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RSS订阅原创 TCGA数据集下载及gdc-client相关问题汇总
本文仅针对使用过程中出现的诸多错误提示符，由于网上关于gdc-client的教程非常多，不做搬运。1.Win 环境下的gdc-client下载与使用：问题：ERROR: Unable to save state: [WinError 17] 系统无法将文件移到不同的磁盘驱动器。解决方案：win环境下目前测试仅能在系统盘，即C盘运行下载，无法手动更改路径至其他，否则会报上述错误。无奈将将对应的gdc-client.exe和gdc_manifest_20210220_064649.txt 复制到C盘
2021-02-20 17:18:41
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原创 [Table] 根据列元素读取文件路径
import pandas as pd def deleteDuplicatedElementFromList(listA): #return list(set(listA)) return sorted(set(listA), key = listA.index)df_test = pd.read_csv('./data/subImage_x40/tes...
2019-04-14 16:18:34
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原创 【Keras】model.fit 中，validation_spilt=num 问题汇总
hist = model.fit(x,y, epochs=epoch_num, batch_size=32,callbacks=early_stopping],validation_split=0.004,shuffle=True)正确写法如上，注意当出现下面问题，或fit函数中其他参数关键字提示问题，优先排查先后顺序，一开始我把callbacks放在了validation_split后面，...
2018-12-21 17:27:05
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原创 【python】批处理文件中涉及的文件名格式化输出问题（补零或固定字段）
类似这样A = 255str_A = str(A)B = "{:0>6}".format(str_A) #方法1print("results: ",A,B) C = str_A.zfill(6) #方法2D = str_A.rjust(6,'0') #方法3，'0'可替换成其他格式字段 ...
2018-11-12 11:12:50
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原创 DICOM “.dcm”数据基本操作方法(python)
声明：本文为作者原创，转载请声明告知，谢谢。首先需要安装dicom包：#旧版pip install dicom #新版pip install pydicom pydicom的官方documents参考 https://pydicom.github.io/pydicom/stable/getting_started.htmlimport pydicomimport p...
2018-11-05 09:27:02
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原创 【新手科普】Linux创建用户
最近接手使用实验室服务器，虽然先前读过《鸟哥私房菜》，不过已经是远古记忆。从0开始，不定期更新……从非常基础非常基础的操作开始…… 开篇，着重提醒 adduser 和 useradd 不同！之前作为小白绕了好一会首先我们需要获取服务器公开的，IP地址，端口号，以及必备的管理员账号（用于给自己添加新用户，当然如果有管理员帮你分配好，可以直接跳过本帖【手动滑稽】）Windows下用...
2018-10-10 17:51:34
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原创 fatal error: Python.h: No such file or directory 解决方案
因使用了github 上的 endernewton/tf-faster-rcnn 代码换机器编译时出现 “fatal error: Python.h: No such file or directory ” 问题。 反复出错。浏览部分帖子，多采用如下方法，但依旧不能解决问题，P.S. 也可以进行尝试，博主没成功采用： sudo apt-get install python3.6-dev ...
2018-10-07 22:06:45
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原创 [tensorboard]常见系列错误，ValueError: GetLogdirSubdirectories: path exists and is not a directory解决方法及防坑指南
很久没有用tensorboard查看图类结构，结果使用 tensorboard --logdir 时一直报 ValueError: GetLogdirSubdirectories: path exists and is not a directory 错误。查了半小时帖子（强迫症），发现自己犯了个低级错误 logdir= log文件所在文件夹目录，而不是指向该文件，其实通过错误字也可以发现该问...
2018-09-09 22:09:44
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原创 基于经典分割算法的图像内细胞识别与计数（matlab实现）（不定期更新完善）
经典图像算法（边界检测+形态学+逻辑运算+填充）的细胞计数与识别标记matlab实现。
2018-05-11 21:48:00
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原创 图像数据集制作——窗位窗宽+归一化处理【python版本】
在图像训练集制作中，尤其对于医学影像，为了获得更好的训练效果，往往需要增大图像间像素值差异。同时，为了防止训练中出现数值暴增，补充简单归一化处理。源代码import numpy as npimport matplotlib.pyplot as plt import randomimport math#-----------data-----------#rawData = n
2018-02-05 21:28:14
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原创 win7-tensorflow查看当前运算器件及无法正常切换CPU/GPU运算器件问题解决方案
博主先前cpu版本安装正常，gpu版本安装出现红字，未重视。实际测试正常，就囫囵吞枣的使用了。前段时间，突然查看器件，突然发现打印出来的cpu器件，非GPU器件，故而查错。查看方法例程如下：# # Creates a graph. # a = tf.constant([1.0, 2.0, 3.0, 4.0, 5.0, 6.0], shape=[2, 3], name='a') #
2017-12-28 19:05:02
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原创 tensorflow+python MNIST数据抽样可视化+前向运算过程
TensorFlow下运用自带input_data接口图取数据，抽样单个数据，1*784 reshape为 28*28 ，最后可视化显示
2017-12-18 14:45:49
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原创 TensorFlow- win+anaconda环境import包错误(error: .dll not found类问题)
最近将一些以前的网络从caffe移植到tensorflow上，偷懒喜欢windows环境，就在win下部署了tensorflow。具体的安装方法请见我的安装帖。安装配置完成后，在jupyter中：from tensorflow.examples.tutorials.mnist import input_data 出现C:\Users\liu\Ap
2017-12-13 11:18:50
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原创 caffe:lr_policy用法
// The learning rate decay policy. The currently implemented learning rate // policies are as follows: // - fixed: always return base_lr. // - step: return base_lr * gamma ^ (floor(iter
2017-12-12 12:39:00
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原创 windows下运用matlab绘制caffe训练日志文件中的loss曲线
windows下运用matlab绘制caffe训练日志文件中的loss曲线。包含分解步骤和程序。
2017-11-14 11:54:12
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原创 校园网neetkeepr在Ubuntu系统下的替换方法（openkeeper方法）
首先在terminal下输入以下命令，通过github获取openkeeper源码，同时进入下载源码目录从而完成安装。$ cd /tmp && git clone https://github.com/Eventide/openkeeper-cli.git && cd openkeeper-cli && make && sudo make install注意，对于小白同学，
2017-10-12 21:09:26
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原创 更改jupyter-notebook默认workspace目录
1.打开 cmd ，输入命令 jupyter notebook --generate-config，将生成 jupyter_notebook_config.py文件2.在C:\Users\Administrator\.jupyter 中的文件找到文件 jupyter_notebook_config.py3.用记事本打开找到 # The directory to use for no
2017-10-02 11:24:34
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