FFTW概述
FFTW ( the Faster Fourier Transform in the West) 是一个快速计算离散傅里叶变换的标准C语言程序集,其由MIT的M.Frigo 和S. Johnson 开发。可计算一维或多维实和复数据以及任意规模的DFT。
FFTW 还包含对共享和分布式存储系统的并行变换,它可自动适应你的机器, 缓存,存储器大小,寄存器个数。
FFTW 通常比其它开源Fourier变换程序都要快,最新版本为fftw-3.3.8。
FFTW 的编码生成器采用面向对象设计技术和面向对象语言Caml 编写;它能自动适应系统硬件,因而可移植性很强。FFTW2.1.5 支持共享存储多线程并行和分布式存储 MPI 并行。FFTW 的运算性能远远领先于已有的其它 FFT 软件。
FFTW 为任意大小的模式生成一个计划(plan),通过对该计划施行各种运算完成各种模式的转换;内部结构及其复杂性对用户透明;速度快 (适合各种机器的内部编译器、代码生成器利用 AST 在运行时生成代码并自我优化,而且不占用编译时间,采用分层存储技术)。
FFTW 受到越来越多的科学研究和工程计算工作者的普遍青睐,并为量子物理、光谱分析、音视频流信号处理、石油勘探、地震预报、天气预报、概率论、编码理论、医学断层诊断等领域提供切实可行的大规模 FFT 计算。
在配有Intel处理器的机器上,安装MKL数学库后,可以直接使用fftw,且速度比较快。但是没有intel处理器的机器上,不能安装MKL数学库,若想使用fftw,必须在自己机器上编译和安装。
Linux系统编译与安装
安装包:fftw-3.3.8.tar.gz
在安装包所在的路径下,一次执行以下命令,即可完成fftw的编译与安装
tar -xzvf fftw-3.3.8.tar.gz
cd fftw
./configure --prefix=/home/FFTW LDFLAGS=-L/home/FFTW/lib FC=ifort F77=ifort CC=gcc CXX=g++ --enable-mpi -enable-shared --enable-float
make
make install
根据实际需要,可以修改./configure的参数
使用示例
FFTW安装完成后,就可以使用了,下面给出了SAR成像的距离向FFT的例子。
相关代码和并行加速方案可以留言或私信
/************************************************************************************
* 距离向FFT
************************************************************************************/
int RangeFFT(MKL_Complex* sig, long Na, long Nr)
{
long i, j, k, l, m, kk, ll, mm, nn;
long lBlock_Size = 64;
unsigned char fftw_Flags = FFTW_MEASURE;
#pragma omp parallel shared(sig) private(i,j)
{
fftwf_plan sS3_Plan;
fftwf_complex *sS3_fftwf;
sS3_fftwf = (fftwf_complex*)fftwf_malloc( Nr * sizeof( fftwf_complex ) );
sS3_Plan = fftwf_plan_dft_1d( Nr , sS3_fftwf , sS3_fftwf , FFTW_FORWARD , fftw_Flags );
#pragma omp for schedule(static,1)
for ( i = 0; i < Na; i++ )
{
for ( j = 0; j < Nr; j++ )
{
sS3_fftwf[j][0] = sig[i*Nr+j].re;
sS3_fftwf[j][1] = sig[i*Nr+j].im;
}
fftwf_execute( sS3_Plan );
for ( j = 0; j < Nr; j++ )
{
sig[i*Nr+j].re = sS3_fftwf[j][0];
sig[i*Nr+j].im = sS3_fftwf[j][1];
}
}
fftwf_free(sS3_fftwf);
fftwf_destroy_plan(sS3_Plan);
}
return 0;
}