【论文简读】Diffusion Kernel Attention Network for Brain Disorder Classification用于脑疾病分类的扩散核注意力网络

期刊:MIA 2022 early accept

作者:Jianjia Zhang, Luping Zhou, Lei Wang, Mengting Liu and Dinggang Shen

摘要

【背景】

构建和分析功能性脑网络(FBN)已成为一种很有前途的脑疾病分类方法,由于过程中子任务之间缺乏交互和适应性,传统的连续构建和分析过程会限制性能。

Transformer 在各种任务中表现出卓越的性能,这归功于其在复杂特征关系建模方面的有效注意力机制。

【本文工作】

在本文中,我们首次开发了 Transformer,用于集成 FBN 建模、分析和脑疾病分类与 rs-fMRI 数据,提出了一个扩散内核注意网络来解决特定挑战

  • 具体来说,直接应用 Transformer 不一定能在此任务中获得最佳性能,因为它在注意力模块中的广泛参数与通常可用的有限训练样本相比。针对这个问题,我们建议使用内核注意力来替换 Transformer 中原来的点积注意力模块。这显着减少了要训练的参数数量,从而缓解了小样本问题,同时引入了非线性注意力机制来模拟复杂的功能连接
  • FBN 应用的 Transformer 的另一个限制是它只考虑直接连接的大脑区域之间的成对交互,而忽略了重要的间接连接。所以,我们进一步探索内核注意力的扩散过程,以纳入间接连接的大脑区域之间更广泛的相互作用。

【实验结果】

对用于 ADHD 分类的 ADHD-200 数据集和用于阿尔茨海默病分类的 ADNI 数据集进行了广泛的实验研究,结果表明所提出的方法优于竞争方法。

Intro

功能核磁可以用于疾病分类

  • 传统方法先通过识别大脑节点并推断它们之间的联系来构建典型的FBN,然后可以从FBN中提取各种特征进而进行分类。存在缺点:1 由于两个步骤之间缺乏通信,其性能可能不是最佳的;2 传统的FBN构建和分析方法会限制其适用性。
  • 文献[27][28]用神经网络方法进行分类,也存在一些不足。
  • transformer的特性以及不足,结合问题进行分析。

【本文工作】

本文提出了一种扩散核注意网络用于脑疾病分类,该网络以变压器的编码器网络为骨干。

第一个设计点:核函数代替注意力

提出了一种内核注意机制来取代原有的注意模块。建议在注意模块中使用一个核函数来代替原来的点积操作,从而形成一种内核注意机制,然后计算该空间中数据对之间的内积来实现特征相似性度量。自我注意的计算需要更少的参数,这些参数可以在模型训练过程中自动学习。这不仅大大减少了要优化的参数数量,缓解了小样本问题而且引入了非线性注意机制来模拟大脑区域之间的复杂交互。我们的工作是

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我们研究了什么因素导致通过电子邮件网络传播不同类型的信息,以及这些传播方式对信息工作者的生产力和绩效的影响。 我们特别要问:什么能预测一个人了解战略性信息或早日意识到这一信息的可能性? 不同类型的信息是否表现出不同的传播方式,社会结构,关系和个人的不同特征反过来又会影响对不同类型信息的访问? 更好地获取信息是否可以预测个人完成项目或创收的能力? 我们使用有关项目合作关系的会计数据和十个月的电子邮件流量来描述一家中型高管招聘公司的社交网络。 通过它们的使用特征,我们确定了两种不同类型的信息在此网络上传播-“事件新闻”和“讨论主题”,并观察了每种信息类型的数千个传播过程。 我们发现新闻传播的特点是传播的激增和通过组织的快速而普遍的传播,它受人口和网络因素的影响,但不受功能关系(例如,先前的合作,权威)或联系强度的影响。 相反,讨论主题的扩散表现出以“来回”对话为特征的浅层扩散,在很大程度上受到功能关系和联系强度以及人口和网络因素的影响。 讨论主题更可能在组织层次结构中上下垂直传播,跨越与先前工作历史的关系以及更牢固的联系,而新闻则更可能横向和纵向传播,而不考虑新闻发布会的力量或功能。关系。 我们还发现,对信息的访问强烈地预测了项目的完成和创收。 这种影响在经济上很重要,每增加一个“单词”,就会产生约70美元的额外收入。 我们的发现为电子邮件网络中信息传播的经济意义提供了一些初步证据。
背景:受连接障碍和炎性细胞因子影响的认知障碍一直是包括精神分裂症、双相情感障碍和重度抑郁症在内的主要精神疾病 (MPD) 中最突出的特征。 共同点要求采用跨诊断和维度的方法来描绘 MPD 之间大连接、认知和炎症之间关系的潜在神经机制。 方法:从一个地点招募了 1543 名参与者,包括 1058 名患有 MPD 的人和 485 名健康对照者在这个研究中。 参与者接受了弥散张量成像和静息状态功能磁共振成像,大多数参与者(n = 1169,765 名 MPD 参与者和 404 名健康对照者)也完成了威斯康星卡片分类测试 (WCST)。 血液样本是在成像后 24 小时内从 325 名参与者那里获得的。 分数各向异性 (FA) 和区域功能连接 (FC) 分别用于测量结构和功能连接。结果:使用 IL-1β、IL-6 和 TNF-α 评估炎性细胞因子指数的差异。 WCST 缺陷与 FA 降低有关; 增加区域FC; MPDs 中 IL-1β、IL-6 和 TNF-α 升高。 额边缘-纹状体区域内重叠的结构和功能连接障碍导致 MPD 之间的认知缺陷。 中介分析表明,IL-1β 介导了 FA 和 WCST 之间的关联,IL-6 介导了区域 FC 和 WCST 之间的关系。 MPDs 之间的认知途径。 特定细胞因子的影响允许更有针对性的研究和可能更有针对性的干预措施,可能会改善 MPD 的认知。 资金声明:本研究由国家杰出青年科学基金(81725005 至 FW)、中国国家自然科学基金(81571311 至YT, 81571331 to FW), 国家重点研发计划项目 (2018YFC1311604 to YT, 2016YFC1306900 to YT, 2016YFC0904300 to FW), 国家高技术发展计划 (863) (2015AA004 to FW) (2015AA0502015 科学技术项目 (2015AA0502015) )、辽宁省教育基金会(潘登学者转FW)、辽宁省高等教育创新团队支持计划(LT2017007转FW)、中国医科大学重大专项建设计划(3110117059转FW)。 利益申报:作者报告没有生物医学经济利益或潜在的利益冲突。伦理批准声明:该研究已获得机构审查委员会的批准中国医科大学,按照赫尔辛基宣言进行。 所有实验和方法均按照批准的指南和规定进行。 所有受试者均提供书面知情同意书。

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