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RSS订阅原创 Affymetrix芯片分析：获取差异表达基因系列一
library(affy)%把affy包载入R中library(tcltk)%把tcltk包载入R中filters cel.files data.raw n.cel sampleNames(data.raw)%查看文件名sampleNames(data.raw) pData(data.raw)$treatment pData(data.raw)%指针p
2015-12-08 17:07:49
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原创 Affymetrix芯片分析：获取差异表达基因系列三_SAM
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite("ArrayExpress")library(ArrayExpress)AEsetGEO中哮喘相关的基因表达谱数据（编号GSE470） save(AEset,file="AEset.RData")load("AEset.RData")clas
2015-12-08 17:05:21
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原创 Affymetrix芯片分析：获取差异表达基因系列二_Moderated t-test
library(limma)library(tcltk)library(affy)filters cel.files data.raw design colnames(design) eset.rma esetfit contrast.matrix f
2015-12-07 11:49:14
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原创 TCGA-Assembler工具下载数据
美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱（Cancer Genome Atlas，TCGA）计划，试图通过应用基因组分析技术，特别是采用大规模的基因组测序，将人类全部癌症（近期目标为50种包括亚型在内的肿瘤）的基因组变异图谱绘制出来，并进行系统分析，旨在找到所有致癌和抑癌基因的微小变异，了解癌细胞发生、发展的机制，在此基础上取得新的诊断和治疗方法，最后可以勾画出整个新型“预防癌症的策略”。TCGA 使
2015-11-14 16:01:40
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原创 CHIPSeq的原理和应用
染色质免疫共沉淀技术（CHIPSeq，也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将与第二代测序技术相结合的技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的区段。CHIPSeq的原理是：首先通过染色质免疫共沉淀技术（特异性地富集目的蛋白结合的片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的片段进行高通量测序。
2015-11-06 19:44:39
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转载 如何使用NCBI资源
美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)，即我们所熟知的NCBI是由美国国立卫生研究院(NIH)于1988年创办。创办NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库，其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据
2015-11-06 12:20:20
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空空如也
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