原文
GeoMol: Torsional Geometric Generation of Molecular 3D Conformer Ensembles
https://github.com/PattanaikL/GeoMol
电脑参数
nvcc: NVIDIA (R) Cuda compiler driver
Copyright (c) 2005-2019 NVIDIA Corporation
Cuda compilation tools, release 10.2
Method1:按作者给的方法安装(依赖包必须大部分和作者使用的依赖包版本一致才可以,后续会有各种冲突bug,不建议使用该方法)
- 下载作者的安装包
git clone https://github.com/PattanaikL/GeoMol.git
在安装包下载的目录下,run make conda_env 安装依赖包
Method2:手动依次安装github上列出的依赖包
注意:安装最新版本的pytorch 和 pyg,和作者的脚本会有冲突,建议针对pytorch和pyg单独安装版本。
(1)安装pytorch 1.7.0(作者用的版本,避免之后冲突最好装一样的版本)(要根据自己的cuda版本找到对应的安装command,