安装DeepDrugCoder (DDC)环境

  1. 本地创建DeepDrugCoder 文件夹,之后所有下在的包都在此路径下,以防之后找不到相关文件。

在此路径下 git clone https://github.com/pcko1/Deep-Drug-Coder.git(把所有包下载下来)

在此路径下 conda 创建环境,所有依赖包都安装在这个环境中:conda env create -f env/ddc_env.yml.

2. 安装外部依赖包molvecgen(生成分子矩阵)

python -m pip install git+https://github.com/EBjerrum/molvecgen

3. 安装内部依赖包(把当前路径下的所有安装包全部一键安装)

pip install .

4. 安装jupyter的环境(便于之后在jupyter里运行)

python -m ipykernel install --user --name ddc_env --display-name "ddc_env (python_3.6.7)"

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