安装MPICH并运行第一行代码

目录

安装MPICH

试运行代码

进阶Python版

---

 

安装MPICH

1、官网-下载地址：

MPICH | High-Performance Portable MPI

 2、放入Linux中，解压：

tar -xvf mpich-4.0.2.tar.gz

3、配置安装：

cd mpich-4.0.2/

./configure

如果没有 Fortran 编译器，则可以避免构建 MPI Fortran 库：

./configure --disable-fortran

（此处配置等待较久...）

如果报错说“Aborting because C++ compiler does not work.”，就安装下编译器：

sudo apt install g++

4、编译安装：

make; sudo make install

（此处编译等待更久...） 

如果报错说无make指令，就安装下cmake：

sudo apt install cmake

5、验证安装是否完成：

mpiexec --version

 安装完成。

试运行代码

• MPI相关教程，推荐看(下面的示例就是摘自这里)：A Comprehensive MPI Tutorial Resource · MPI Tutorial
• 配套代码在：GitHub - mpitutorial/mpitutorial: MPI programming lessons in C and executable code examples​​​​​​

1、待运行的源文件demo.c：

#include <mpi.h>
#include <stdio.h>

int main(int argc, char** argv) {
  // 初始化MPI环境。
  // MPI Init的两个参数目前没有被MPI实现使用，但是为了以防将来实现可能需要这些参数。
  MPI_Init(NULL, NULL);

  // 通过调用以下方法来得到所有可以工作的进程数量
  int world_size;
  MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);

  // 得到当前进程的rank
  int world_rank;
  MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);

  // 得到当前进程的名字
  char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
  int name_len;
  MPI_Get_processor_name(processor_name, &name_len);

  // 打印一条带有当前进程名字，rank以及整个 communicator 的大小的 hello world 消息。
  printf("Hello world from processor %s, rank %d out of %d processors\n",
         processor_name, world_rank, world_size);

  // 释放 MPI 的一些资源. 在此之后不能再进行MPI调用
  MPI_Finalize();
}

2、再编写makefile：

EXECS=demo
MPICC?=mpicc

all: ${EXECS}

demo: demo.c
	${MPICC} -o demo demo.c

clean:
	rm ${EXECS}

3、然后编译：

make

 注意：如果想要在好几个节点的集群上面跑这个 MPI 程序的话，就需要配置一个 host 文件（不是 /etc/hosts）。如果在笔记本或者单机上运行的话，可以跳过下面这一段。

需要配置的 host 文件会包含你想要运行的所有节点的名称。为了运行方便，你需要确认一下所有这些节点之间能通过 SSH 通信，并且需要根据[设置认证文件这个教程](http://www.eng.cam.ac.uk/help/jpmg/ssh/authorized_keys_howto.html)配置不需要密码的 SSH 访问。 我的 host 文件看起来像这样：

host_file：

cetus1:2
cetus2:2
cetus3:2
cetus4:2

（冒号后面的数字表示每个处理器有的核数，也可以不加“冒号和后面的数字”）

应该设置一个叫 MPI_HOSTS 的环境变量，把它指向 host 文件所在的位置。如果单机跑的话就不用设置这个环境变量。

export MPIRUN=/home/kendall/bin/mpirun
export MPI_HOSTS=host_file

4、然后运行：

单机下：

mpirun -n 4 ./demo

或者多机时：

mpirun -n 4 -f host_file ./demo

进阶Python版

上面的MPICH使用C和C++开发，但其实也有Python绑定版，对大部分同学来说这个会更友好。

Python版MPICH库名为：mpi4py，文档推荐：

11. 使用Python的mpi4py模块 — python-parallel-programming-cookbook-cn 1.0 文档

使用起来简单直观多了。

1、安装mpi4py库：

首先也要先安装上面的MPICH，然后：

pip3 install mpi4py

（可能会卡主比较久...）

2、编写helloWorld_MPI.py：

from mpi4py import MPI

comm = MPI.COMM_WORLD
rank = comm.Get_rank()
print("hello world from process ", rank)

3、然后运行：

mpiexec  -n 5 python3  helloWorld_MPI.py

或

mpirun -np 3 python3 mpi_helloworld.py