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原创 Illumina Fastq Q-score
Illumina Nextseq500 Miseq HiseqXten 测序仪 Q-score均采用下面的编码格式,仅作简要介绍。Q-scoreQ-score 在fastq中每个序列的第4行,代表测序错误的概率。Quality Score Q(X) ## Error Probability P(~X) Q40 ##
2017-07-25 15:52:54 8521
原创 python.snippet
python 的代码片段, 拿出来分享。#!/usr/bin/env python# -*- coding: utf-8 -*-"""desc"""# ---------# Change Logs:## ---------__author__ = 'Pidong'__email__ = '***'__version__ = '1.0.1'__status__ = 'Producti
2017-07-25 13:57:23 7219
原创 Dockerfile 模版
最近一直在用docker,总结了一个靠谱的模版,分享给大家。From ubuntu:14.04MAINTAINER pidong.li@genetronhealth.comRUN echo deb http://mirrors.163.com/ubuntu/ trusty main restricted universe multiverse>/etc/apt/sources.listRUN ec
2017-07-25 11:01:26 6683
原创 pip国内镜像(清华大学镜像)
网上搜到的pip国内镜像大部分是豆瓣的 http://pypi.douban.com/simple/但是根本不全,很多包没有所以推荐清华大学的https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple临时使用可以在使用pip的时候加参数-i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple 例如:pip install -i https://
2017-07-24 16:20:54 458143 12
原创 Celery分布式应用
最近有应用需要部署到不同的服务器上运行,但是有没有PBS这样的调度系统,就想起来Python的调度神器 Celery。现在针对我的实际应用做一些记录。1. 安装因为我并不注重结果而是把命令拿到不同的机器上运行,所以消息代理和结果保存我都选择了 Redis# 只需要在一台服务器上安装 redis,其他服务器均使用该服务器redis即可sudo apt-get install redis-server
2017-07-22 14:26:40 6491
linux非root安装软件设置
2016-04-13
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