ITK-SNAP的学习(一)软件下载及数据导入

首先下载ITK-SNAP软件,下载方法参考这位博主:

医学影像处理软件ITK-SNAP_itksnap下载-CSDN博客

之后根据默认勾选(除安装地址以外)完成安装。

完成安装打开之后的页面如图:

接下来是数据的准备,可以使用3D-Slicer下载数据File -> Download Sample Data -> 点击要下载的数据图像,我下载的是CTChest,点击下载之后找到文件的保存路径:

CTChest文件的保存格式为nrrd。

另一种下载DICOM格式图像的方式是下载该链接中的文件,这里面得到的是dcm格式文件:

DICOM Library - Anonymize, Share, View DICOM files ONLINE

将图像导入ITK-SNAP也可以通过拖拽的方式,然后点击Next。要注意Dimentions不能过大,否则会导入失败:

然后会出现图像的一些基本信息,点击Finish自动加载图像:

基本界面如图,分别点击A、S、C可以显示单独的图像:

按住鼠标右键,上下拖动鼠标即可放大缩小图像。

按住鼠标滚轮,拖动鼠标即可移动图像。

若要将该图像存储为其他类型点击File -> Save Image -> Main Image:

关闭图像点击File -> Close All Images即可。

查看图像基本信息的两种方法,一种是在工具栏Main Toolbar中找到Layer Inspector:

另一种是点击菜单栏Tools -> Layer Inspector即可查看。

其中General显示文件的存储路径:

在Contrast中可以看到图像灰阶的范围,并进行窗宽窗位的调节:

在Color Map中可以选择图像显示颜色的模式:

Info中显示图像的基本信息:

Metadata中包含图像头文件信息:

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ITK-SNAP 是一款开源的医学图像分割和三维可视化软件,它提供了一系列用于医学图像处理的功能。 ITK-SNAP 的源码是指软件开发过程中所使用的代码和相关资源。这些源码是开放的,任何人都可以查看、使用和修改。使用源码,你可以了解软件的实现细节,根据自己的需求进行定制和扩展。 ITK-SNAP 的源码基于ITK(Insight Segmentation and Registration Toolkit)和 Qt 框架,这两个框架提供了图像处理和图形界面开发的基础功能。ITK-SNAP 的源码主要包括以下几个方面: 1. 图像处理算法:ITK-SNAP 的源码中包含了许多基于ITK的图像处理算法,如图像滤波、分割、配准等。这些算法是开发者对医学图像进行分析和操作的基础。 2. 三维可视化:ITK-SNAP 可以对医学图像进行三维可视化,它可以显示体积渲染、表面重建等效果。源码中包含了实现这些功能的相关代码。 3. 用户界面:ITK-SNAP 的源码中包含了用户界面的设计和实现代码,包括窗口、菜单、工具栏等,这些界面为用户提供了交互式操作医学图像的功能。 通过查看 ITK-SNAP 的源码,开发者可以学习到许多医学图像处理和可视化的方法和技术。同时,源码也提供了一个自由和灵活的平台,使开发者可以根据自己的需求对软件进行修改和扩展。 总之,ITK-SNAP 的源码是开源社区分享的宝贵资源,它为医学图像处理和可视化的研究和应用提供了有力的支持。无论是学习、研究还是应用,ITK-SNAP 的源码都是一个重要的参考和工具。
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