MIT-BIH Arrhythmia Database的讀取和使用

最新推荐文章于 2023-08-26 11:54:28 发布
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分类专栏： ECG 文章标签： MITBIH ECG 心電訊號
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本文链接：https://blog.csdn.net/u010060391/article/details/43115085
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本文详细介绍了如何下载和使用MIT-BIH Arrhythmia Database，包括数据的三种存储格式（.atr, .dat, .hea）以及在不同环境下（如Windows上的Cygwin和MATLAB）的心电信号读取方法。提供了数据库的官方下载链接和WFDB库的安装资源。" 43673421,1447201,Kettle在ETL中的角色与应用,"['数据仓库', 'ETL工具', 'Kettle', '数据处理', 'Java API']
摘要由CSDN通过智能技术生成

這學期一直在做關於ECG訊號的研究，都是以MITBIH Arrhythmia Database爲基礎，所以把MIT-BIH數據庫的内容整理一下。

1.MIT-BIH數據庫的下載：

DATABASE DOWNLOAD 及相關數據庫説明： Introduction

2.數據存儲格式：

以下截圖爲從官網上找到的數據庫，一共48組訊號。

有三種數據存儲格式：

（1）[.atr]：爲注釋檔。二進制存儲。通過這個文檔，我們可以讀取到相關beat的種類，如normal beat, RBBB beat等。

（2）[.dat]：數據文件，按照二進制存儲，存儲著signal數據。每三個字節存儲兩個數，一個數12bits。

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MIT-BIH 心律失常数据库介绍
goudahai的专栏
07-14 1万+
空间MIT-BIH Arrhythmia Database.MIT ---- Massachusetts Institute of Technology ，麻省理工学院BIH ---- Beth Israel Hospital ，医院名，位于波士顿，麻萨诸塞州，美国 This collection of 48 fully annotated half-hour two-lead ECGs is a...
MIT-BIH Arrhythmia Database 心率不齐数据下载脚本（python3）
12-14
下载 MIT-BIH Arrhythmia Database 中的心率不齐数据--标注文件，说明文件，数据文件）
MIT-BIH Arrhythmia Database 数据下载及matlab处理程序
playlinuxxx的博客
12-14 2682
原始数据下载 MIT-BIH 网站 项目需要MIT-BIH 的心律不齐数据，文件没有全部下载的链接，需要一个个单独下载（48份，每份3个文件，标注文件，说明文件，数据文件），费时费力，于是编写简单脚本（PYTHON3）下载这些数据。 数据下载脚本 原始MIT格式读取为mat格式数据 原始MIT-BIH 为自己独有的一种格式存储，省空间，需要使用matlab程序读取，下面的程序可以读取存储为m
MIT-BIH Arrhythmia Database 原始数据读取 matlab程序
12-14
MIT-BIH Arrhythmia Database 原始数据读取 matlab程序
python MIT-BIH 数据集心拍分类 从R点提取到19类R点心拍分类到AAMI标准5分类的数据集打包实现 良心详解版 全网唯一
一个学长的博客
11-06 1万+
python MIT-BIH 心拍分类实现 前言 这可能是我自认为写的最难的一篇文章,对于所有做心电信号分类的同学来说这都是一大关一下所有的代码都是自己手敲的,这整个过程很复杂,按照我一贯的思路,我会写的很详细一是日后方便复习,二是自己看论文也好看文章也罢,好多都是囫囵半片,看了跟没看似的,所以自己一定要写的很详细,一是自己对理论的一种梳理和理解,二是给相关的研究者提供清晰的思路,三是希望能给学弟学妹们做个榜样接下来进入正题 一.本文的主要内容和研究思路 首先不管对于机器学习还是深度学习,不管你最后要做的是
心律失常数据集mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0
11-06
"心律失常数据集mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0" 是一个广泛用于心脏生理研究和心电图（ECG）分析的重要资源。这个数据集由麻省理工学院（MIT）和波士顿哈佛附属医院（BIH）联合发布，专门用于研究和检测心律...
The Impact of the MIT-BIH Arrhythmia Database
01-25
《MIT-BIH心律失常数据库的影响：历史、经验教训及其对未来数据库的启示》 **一、MIT-BIH心律失常数据库的历史与背景** MIT-BIH心律失常数据库自1980年问世以来，已成为全球范围内评估心律失常检测器的标准测试...
MIT-BIH心电数据库txt格式.rar_MIT-BIH_MIT-BIH心电_MIT-BIH心电数据库txt格式_bih123
09-25
MIT-BIH心电数据库，全称为Massachusetts Institute of Technology - Beth Israel Hospital Arrhythmia Database，是全球公认的心电图（ECG）研究的重要资源，由美国麻省理工学院（MIT）与波士顿贝斯以色列医院（BIH...
MIT-BIH.rar_MIT BIH保存格式_MIT-BIH_mitbih格式
09-24
MIT-BIH数据库，全称为Massachusetts Institute of Technology-Boston University-Beth Israel Hospital Arrhythmia Database，是心脏病学领域广泛应用的一个心电图（ECG）数据库，由麻省理工学院、波士顿大学和贝斯...
MIT-BIH ECG 心电数据+matlab绘图详解
11-30
MIT-BIH ECG 心电数据（1min，具体信息里面有，像采样率什么的），里面有mat文件； plotSTM可以用来matlab绘图； 程序有详解；
心电数据库学习
最新发布
weixin_46048966的博客
08-26 1660
美国的MIT-BIH心电数据库是目前在国际上应用最多的数据库，由很多子数据库组成，每个子数据库包含某类特定类型的心电记录，其中应用的最多的是MIT-BIT心律不齐数据库和MIT-BIT QT数据库。自1999年，在美国国家研究资源中心和国家健康研究院的支持下，他们将该数据库公开到了Internet上，整个MIT-BIT数据库的所有数据都可以免费下载和使用，国内外许多心电方面的研究都是基于该数据库的，使用该数据库作为实验数据的来源和各类识别算法的检测标准。记录在 SVTA 的情节期间结束。
ECG心电信号处理：使用WFDB对MIT-BIH数据集进行读取（Python）
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本文的主要内容是详细介绍MIT-BIH心电数据集的读取，主要使用WFDB-python工具进行操作，能够读取心电信号数据到array中，读取annotations以及使用matplotlib绘制相应的心电信号波形，并对record和annotation数据结构进行简单的分析。 声明：本博客的内容来源于各大论文和互联网，其正确性有待考究。目的仅仅为了记录一下本人的学习过程，如果正好也能对你有一点帮...
MIT-BIH介绍（三）如何使用MIT-BIH？
Cou流氓也要有文化的博客
12-28 7920
MIT-BIH的下载和读取 1. Download 官方下载地址 https://www.physionet.org/content/mitdb/1.0.0/ 由头文件[.hea]，数据文件[.dat]，注释文件[.atr]组成。 Kaggle数据集下载 https://www.kaggle.com/mondejar/mitbih-database 由数据文件[.csv]和注释文件[.txt]组成。   2. 官网工具读取 PhysioBank ATM 输入参数 Databa
鸢尾花数据分析
hcc13974721431的博客
11-02 3478
1.利用python sklearn下载鸢尾花数据集，并分析数据集的维度属性，绘制二维散点图； 2.同时对鸢尾花数据集利用PCA和t-SNE进行降维，并对降维的结果进行可视化；
目前常用 心电数据库ECG：MITBIH,AHA,CSE,ST-T,PTB,PAF 详细介绍+下载
HJ33_的博客
09-21 1万+
首先声明是转载的文章，原文指路：https://blog.csdn.net/zsg2063/article/details/76615924 担心原文链接失效，所以这里自己复制了一份。 一、四大数据库概述 目前国际上最重要的，具有权威性的心电数据库有四个： 美国麻省理工学院与Beth Israel医院联合建立的MIT-BIH心电数据库； 美国心脏学会的AHA心律失常心电数据库； 欧盟的CSE心电数据库； 欧盟ST-T心电数据库。 除此之外国际上被广泛认可的还有Sudden Cardiac DeathHolt
第一次应该如何使用在GitHub下载的深度学习模型？
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新手入门深度学习？如何使用github上的模型来学习，从配置环境，以及中间遇到的问题来帮助你解决该问题。
MIT-BIH ECG 心电数据的下载和读取图解
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晨宇思远
01-06 12万+
一、如何下载获取MIT-BIH的数据从下面这个官方链接页面可以下载到所有48组MIT-BIH心电数据：http://www.physionet.org/physiobank/database/mitdb/     下面这个链接是MIT-BIH数据库的详细说明和使用指南，英文好的同学不妨仔细阅读：http://www.physionet.org/physiobank/database/html/mi
请用python中的keras处理MIT-BIH Arrhythmia Database
05-13
处理MIT-BIH Arrhythmia Database可以用Python中的wfdb库来实现，而使用Keras来处理则需要将数据集转换成适合Keras使用的格式。以下是使用Keras处理MIT-BIH Arrhythmia Database的基本步骤： 1. 安装wfdb库，可以使用以下命令： ``` !pip install wfdb ``` 2. 下载MIT-BIH Arrhythmia Database，可以从PhysioNet网站上下载。下载后，将数据集解压缩到指定的目录中。 3. 使用wfdb库读取数据集，并将数据转换成适合Keras使用的格式。以下是示例代码： ``` import wfdb from keras.utils import to_categorical record = wfdb.rdrecord('path/to/MIT-BIH-arrhythmia-database/100', sampto=3000) annotation = wfdb.rdann('path/to/MIT-BIH-arrhythmia-database/100', 'atr', sampto=3000) data = record.p_signal labels = to_categorical(annotation.symbol) ``` 这里读取了第一个记录（100）的前3000个样本，并使用to_categorical函数将注释标签转换成独热编码。 4. 将数据集划分为训练集、验证集和测试集。可以使用sklearn库中的train_test_split函数来实现。 ``` from sklearn.model_selection import train_test_split x_train, x_test, y_train, y_test = train_test_split(data, labels, test_size=0.2, random_state=42) x_train, x_val, y_train, y_val = train_test_split(x_train, y_train, test_size=0.2, random_state=42) ``` 这里将数据集分成了训练集、验证集和测试集，其中训练集占64%，验证集占16%，测试集占20%。 5. 使用Keras搭建模型并训练。可以使用Sequential模型来搭建模型，并使用fit函数进行训练。 ``` from keras.models import Sequential from keras.layers import Dense, Flatten, Conv1D, MaxPooling1D model = Sequential() model.add(Conv1D(filters=32, kernel_size=5, activation='relu', input_shape=(3000, 2))) model.add(MaxPooling1D(pool_size=2)) model.add(Conv1D(filters=64, kernel_size=5, activation='relu')) model.add(MaxPooling1D(pool_size=2)) model.add(Flatten()) model.add(Dense(units=128, activation='relu')) model.add(Dense(units=5, activation='softmax')) model.compile(optimizer='adam', loss='categorical_crossentropy', metrics=['accuracy']) history = model.fit(x_train, y_train, epochs=10, batch_size=32, validation_data=(x_val, y_val)) ``` 这里使用了一个简单的卷积神经网络模型，其中包含两个卷积层和两个最大池化层，最后连接两个全连接层。模型使用adam优化器和分类交叉熵损失函数，训练了10个epoch，并使用批量大小为32的训练数据进行训练。 6. 在测试集上评估模型性能。 ``` test_loss, test_acc = model.evaluate(x_test, y_test) print('Test accuracy:', test_acc) ``` 这里使用测试集数据来评估模型性能，并输出准确率。
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