Paraview图像处理-ParaviewWeb获取渲染图像过程

借助于VTK,Paraview提供了强大的图像处理功能。在VTK中,使用vtkImageData来表示图像的数据结构,它保存了图像的像素、维度、像素间隔等信息,不仅可以表示像素,还可以表示体素。另外,它还可以表示几何体以及拓扑关系(vtkImageData represents a geometric structure that is a topological and geometrical regular array of points)。

vtkImageData继承自vtkDataSet类,该类型的数据是按规则排列在矩形方格中的点和单元的集合,如果数据集的点和单元排列在平面上,称此数据集为像素映射、位图或者图像,如果排列在三维上,则称为体。vtkImageData由一维的线、二维的像素或三维的体素组成,其几何结构以及拓扑结构都是规则的。

vtkImageData中的像素数据采用连续的数组保存,可参看vtkDataArray,对于RGB颜色数据,每个数组是由多个分量组成的,因此采用元(tuple),来表示数据数组的子数组。因此可以使用SetNumberOfComponents(num)来设置元组的组分个数,SetNumberOfTuples(num)设置元组的个数,SetComponent(i,j,k)即设置第i元组中第j个组分的值为k。


vtk中RGB值采用如下图的方式来保存


vtk中图像像素值的访问方法有两种。

第一种:直接访问vtkImageData的数据数组。vtkImageData提供了GetScalarPointer()函数获取数据数组指针;

第二种:通过vtkImageData类实现迭代器。


在ParaviewWeb中,客户端通过远程过程调用stillRender方法,在python中调用Paraview在C++中根据VTK编写的函数StillRenderToString,来获取渲染结果,此时渲染结果经过JPEG压缩以及base64编码之后,返回到python文件的stillRender方法中,通过远程调用返回给客户端,在客户端javascript解码之后,将图像显示在客户端的视口区域。

接下来介绍VTK中StillRenderToString怎么获取base64编码结果。

StillRenderToString在ParaviewWeb的vtkPVWebApplication.h文件中,而该文件是根据vtkWebApplication.h来编写的。vtkWebApplication定义了ParaviewWeb的应用程序接口,获得图片,base64编码;获得WebGL数据,场景数据都封装在这里。StillRender,InteractiveRender,StillRenderToString三个方法用于渲染场景并且获取渲染图片。StillRender中判断是否需要重新渲染图片还是从缓冲区中读取图片,并创建vtkImageData对象image来获取图片,此时会调用GetRenderWindow()方法,获取渲染视口,然后调用vtkWindowToImageFilter,获取绘制图像信息,此时将图像信息保存在capture中,返回到image中。vtkWindowToImageFilter夺取绘制窗口缓冲器,并转换到vtkImageData。

获取图像信息之后,此时只是像素信息,需要对其编码,所以调用Encoder。在vtkDataEncoder.cxx中,调用vtkJPEGWriter对图像像素进行压缩,并写入writer中,writer是一个vtkJPEGWriter模板类的对象,然后便可以通过writer->GetResult()来获取JPEG编码之后的数据,交给data,data是vtkUnsignedCharArray类型。然后通过vtkBase64Utilities对data进行base64编码。(this->Internals->Encoder->PushAndTakeReference(view->GetGlobalID(), image, quality);位于vtkPVWebApplication.cxx)。此后,将数据逐层返回,通过StillRenderToString返回给python中的reply。


另外,python与C++之间相互传递,使用vtkPVWebApplicationPython.cxx,封装vtkPVWebApplication,编译之后可以在python中调用vtkPVWebApplication的方法。

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ParaView是一种用于可视化和分析科学和医学图像数据的开源软件。它具有强大的功能,可以帮助医学图像处理工作。 首先,Paraview能够处理不同类型的医学图像数据,如磁共振成像(MRI)、计算机断层扫描(CT)、超声波图像等。它可以加载和处理这些图像数据,并提供各种处理和分析工具。 其次,Paraview具有灵活的数据可视化功能。它可以根据用户的需求生成高质量的图像和动画,帮助医生和研究人员更好地理解和分析图像数据。例如,它可以创建三维体绘制、表面绘制、切片绘制等可视化效果,以显示医学图像中的特定结构和病变。 此外,Paraview还支持交互式操作,使用户能够自由浏览和操纵图像数据。用户可以旋转、缩放、平移图像,选择感兴趣的区域进行进一步处理和分析。这对于医生和研究人员来说非常重要,因为他们可以更准确地评估病变、观察结构和功能的变化。 最后,Paraview还提供了一些高级功能,如图像配准和分割。图像配准可以将同一患者的不同扫描结果对齐,以便比较和分析。而图像分割可以将图像中的不同结构分离出来,帮助医生确定病变的位置和范围。 综上所述,Paraview是一款强大的医学图像处理软件,它通过数据可视化和分析工具帮助医生和研究人员更好地理解和处理医学图像数据,提供更准确的诊断和治疗方案。

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