动态规划算法之前没好好看,开始做毕设了,现在抱着算法导论啃还花5.5在知网上买了份文献......现在借写Blog将要点再梳理一下。
求解最长公共子序列和最长公共子字符串,运用动态规划算法能很好地解决。
【最长公共子序列】:
一个给定序列的子序列是在该序列中删去若干元素后得到的序列。确切地说,若给定序列 X = { x1,x2,x3,…,xm },则另一序列Y={y1,y2,…,yk},X的子序列是指存在一个严格递增的下标序列 {i1,i2,…,ik} 使得对于所有j = 1,2,3,...,k 有 z j = x ij。例如:X={A,B,C,B,D,A,B},Y= {B,C,D,B} 是X 的一个子序列,相应的递增下标序列为{2,3,5,7}。给定两个子序列X和Y,当另一序列Z既是X的子序列又是Y的子序列的时候,称Z为X和Y的公共子序列。
考虑最长公共子序列问题如何分解成子问题,设A= “a0 ,a1 ,…,am-1”,B=“b0 ,b1 ,…,bm-1”,并Z= “z0 ,z1 ,…,zk-1”为它们的最长公共子序列。不难证明有以下性质:
(1)如果am-1=bn-1 ,则zk-1=am-1=bn-1 ,且“z0 ,z1 ,…,zk-2”是“a0 ,a1 ,…,am-2”和“b0 ,b1 ,…,bn-2”的一个最长公共子序列;
(2)如果am-1!=bn-1 ,则若zk-1!=am-1 ,蕴涵“z0 ,z1 ,…,zk-1”是“a0 ,a1 ,…,am-2”和“b0 ,b1 ,…,bn-1”的一个最长公共子序列;
(3)如果am-1!=bn-1 ,则若zk-1!=bn-1 ,蕴涵“z0 ,z1 ,…,zk-1”是“a0 ,a1 ,…,am-1”和“b0 ,b1 ,…,bn-2”的一个最长公共子序列。
这样,在找A 和B 的公共子序列时,如有am-1=bn-1 ,则进一步解决一个子问题,找“a0 ,a1 ,…,am-2”和“b0 ,b1 ,…,bm-2”的一个最长公共子序列;如果am-1!=bn-1 ,则要解决两个子问题,找出“a0 ,a1 ,…,am-2”和“b0 ,b1 ,…,bn-1”的一个最长公共子序列和找出“a0 ,a1 ,…,am-1”和“b0 ,b1 ,…,bn-2”的一个最长公共子序列,再取两者中较长者作为A 和B 的最长公共子序列。
求解:
引进一个二维数组c[][],用 c[i][j]记录X[i]与Y[j] 的LCS 的长度,b[i][j]记录c[i][j]是通过哪一个子问题的值求得的,以决定搜索的方向 。
我们是自底向上进行递推计算,那么在计算c[i,j]之前,c[i-1][j-1],c[i-1][j]与c[i][j-1]均已计算出来。此时我们根据X[i] = Y[j]还是X[i] != Y[j],就可以计算出c[i][j]。
问题的递归式写成:
回溯输出最长公共子序列过程:
算法分析:
由于每次调用至少向上或向左(或向上向左同时)移动一步,故最多调用(m * n)次就会遇到i = 0或j = 0的情况,此时开始返回。返回时与递归调用时方向相反,步数相同,故算法时间复杂度为Θ(m * n)。
Java代码实现:
public class LCSProblem
{
public static void main(String[] args)
{
//保留空字符串是为了getLength()方法的完整性也可以不保留
//但是在getLength()方法里面必须额外的初始化c[][]第一个行第一列
String[] x = {"", "A", "B", "C", "B", "D", "A", "B"};
String[] y = {"", "B", "D", "C", "A", "B", "A"};
int[][] b = getLength(x, y);
Display(b, x, x.length-1, y.length-1);
}
/**
* @param x
* @param y
* @return 返回一个记录决定搜索的方向的数组
*/
public static int[][] getLength(String[] x, String[] y)
{
int[][] b = new int[x.length][y.length];
int[][] c = new int[x.length][y.length];
for(int i=1; i<x.length; i++)
{
for(int j=1; j<y.length; j++)
{
//对应第一个性质
if( x[i] == y[j])
{
c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1;
b[i][j] = 1;
}
//对应第二或者第三个性质
else if(c[i-1][j] >= c[i][j-1])
{
c[i][j] = c[i-1][j];
b[i][j] = 0;
}
//对应第二或者第三个性质
else
{
c[i][j] = c[i][j-1];
b[i][j] = -1;
}
}
}
return b;
}
//回溯的基本实现,采取递归的方式
public static void Display(int[][] b, String[] x, int i, int j)
{
if(i == 0 || j == 0)
return;
if(b[i][j] == 1)
{
Display(b, x, i-1, j-1);
System.out.print(x[i] + " ");
}
else if(b[i][j] == 0)
{
Display(b, x, i-1, j);
}
else if(b[i][j] == -1)
{
Display(b, x, i, j-1);
}
}
}
【最长公共子字符串】:类似最长子序列,只是公共子字符串要求必须是连续的。
java实现代码如下:
public class stringCompare {
//在动态规划矩阵生成方式当中,每生成一行,前面的那一行就已经没有用了,因此这里只需使用一维数组,而不是常用的二维数组
public static void getLCString(char[] str1, char[] str2) {
int len1, len2;
len1 = str1.length;
len2 = str2.length;
int maxLen = len1 > len2 ? len1 : len2;
int[] max = new int[maxLen];// 保存最长子串长度的数组
int[] maxIndex = new int[maxLen];// 保存最长子串长度最大索引的数组
int[] c = new int[maxLen]; // 记录对角线上的相等值的个数
int i, j;
for (i = 0; i < len2; i++) {
for (j = len1 - 1; j >= 0; j--) {
if (str2[i] == str1[j]) {
if ((i == 0) || (j == 0))
c[j] = 1;
else
//System.out.print("========="+ c[j - 1]+"\n");
c[j] = c[j - 1] + 1;//此时C[j-1]是当前位置左上角元素的值,在二维矩阵上找最长的由1组成的斜对角线也是件麻烦费时的事,
//改进:当要在矩阵是填1时让它等于其左上角元素加1。这样矩阵中的最大元素就是最长公共子串的长度。
}
else {
c[j] = 0;
}
// 如果是大于那暂时只有一个是最长的,而且要把后面的清0;
if (c[j] > max[0]) {
max[0] = c[j]; //记录对角线元素的最大值,之后在遍历时用作提取子串的长度
maxIndex[0] = j; //记录对角线元素最大值的位置
for (int k = 1; k < maxLen; k++) {
max[k] = 0;
maxIndex[k] = 0;
}
}
// 有多个是相同长度的子串
else
if (c[j] == max[0]) {
for (int k = 1; k < maxLen; k++) {
if (max[k] == 0) {
max[k] = c[j];
maxIndex[k] = j;
break; // 在后面加一个就要退出循环了
}
}
}
}
for (int temp : c) {
System.out.print(temp);
}
System.out.println();
}
//打印最长子字符串
for (j = 0; j < maxLen; j++) {
if (max[j] > 0) {
System.out.println("第" + (j + 1) + "个公共子串:");
for (i = maxIndex[j] - max[j] + 1; i <= maxIndex[j]; i++)
System.out.print(str1[i]);
System.out.println(" ");
}
}
}
public static void main(String[] args) {
/* StringBuffer buf1 = new StringBuffer();
StringBuffer buf2 = new StringBuffer();
String str = "abcdefghijklmnopqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ0123456789";
Random random = new Random();
// 生成随机字符串
for(int i = 0 ;i < 10 ; i ++)
{
int num = random.nextInt(62);
buf1.append(str.charAt(num));
}
for(int i = 0 ;i < 10 ; i ++)
{
int num = random.nextInt(62);
buf2.append(str.charAt(num));
}
String str1 = new String(buf1);
String str2 = new String(buf2);
System.out.println(str1+"======="+str2);*/
String str1 = new String("abcbdab");
String str2 = new String("bdcaba");
getLCString(str1.toCharArray(), str2.toCharArray());
}
}