今天使用SparkR(版本1.5.1,操作系统:MAC Capitan 10.11) ,当对DataFrame进行ACTION类操作的时候,竟然报以下错误:
java.io.IOException: Cannot run program "Rscript": java.io.IOException: error=2, No such file or directory
ACTION类操作可以正式发起Spark JOB,从错误堆栈信息看到,导致的原因是Spark在JOB中 调用R解释器失败,没有找到该解释器。经验性地想到R解释器没有添加到环境变量。于是遍将Rscript添加到用户环境变量,在终端输入"Rscript",可以看到打印信息。
本以为,问题就应该解决了,但是令人不解的是,问题依旧。不应该啊,都放到环境变量了,Spark怎么还是找不到R解释器?
之后就开始了长达1个小时的探索,终于在一篇github的issue上找到了解答:SparkR现阶段只能在/usr/bin 全局环境下获得Rscript,所以/usr/bin如果没有,可以将Rscript copy到/usr/bin便可(太不优雅了b_b)
既然解决方法如此简单,于是开启root用户,打算将Rscript拷贝到/usr/bin 之下。
然而等待我的是另一个坑:
MAC Capitan 10.11系统 即使是ROOT用户也无法拷贝到/usr/bin 之下
无奈之下,又去找答案(链接:http://www.zhihu.com/question/36108835/answer/65969780)。
/System
/bin
/sbin
/usr (except /usr/local)
均属于Rootless范围,即使root用户无法对此目录有写和执行权限,只有Apple以及Apple授权签名的软件(包括命令行工具)可以修改此目录。
附关闭方法:
重启,开机按住Command + R,以Recovery分区启动,然后选择以下方式
命令行操作
csrutil disable