如何跳过在OSX Capitan上,SparkR Job无法调用Rscript的坑。

今天使用SparkR(版本1.5.1,操作系统:MAC Capitan 10.11) ,当对DataFrame进行ACTION类操作的时候,竟然报以下错误:

 java.io.IOException: Cannot run program "Rscript": java.io.IOException: error=2, No such file or directory

ACTION类操作可以正式发起Spark JOB,从错误堆栈信息看到,导致的原因是Spark在JOB中 调用R解释器失败,没有找到该解释器。经验性地想到R解释器没有添加到环境变量。于是遍将Rscript添加到用户环境变量,在终端输入"Rscript",可以看到打印信息。

本以为,问题就应该解决了,但是令人不解的是,问题依旧。不应该啊,都放到环境变量了,Spark怎么还是找不到R解释器?

之后就开始了长达1个小时的探索,终于在一篇github的issue上找到了解答:SparkR现阶段只能在/usr/bin 全局环境下获得Rscript,所以/usr/bin如果没有,可以将Rscript copy到/usr/bin便可(太不优雅了b_b)

既然解决方法如此简单,于是开启root用户,打算将Rscript拷贝到/usr/bin 之下。

然而等待我的是另一个坑:

MAC Capitan 10.11系统 即使是ROOT用户也无法拷贝到/usr/bin 之下

无奈之下,又去找答案(链接:http://www.zhihu.com/question/36108835/answer/65969780)。

其实,在OS X El Capitan中,内核下引入了Rootless机制,以下路径:

/System
/bin
/sbin
/usr (except /usr/local)

均属于Rootless范围,即使root用户无法对此目录有写和执行权限,只有Apple以及Apple授权签名的软件(包括命令行工具)可以修改此目录。
附关闭方法:
重启,开机按住Command + R,以Recovery分区启动,然后选择以下方式
命令行操作
csrutil disable

最终的解决方法是: 关闭Rootless机制,Rscript拷贝到/usr/bin 之下。便可以解决OSX Capitan上,SparkR无法调用Rscript的问题。
apple在 OSX Capitan上使用Rootless主要是考虑到系统的安全性,在开启Rootless的时候,只有apple公司和其签名的产品才有可能改变以上列举的目录,这非常不方便程序员的使用,而且还导致了一些软件的兼容性问题。

  • 1
    点赞
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值