单细胞分析
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本专栏主要关于单细胞分析内容,文章解析,代码相关整理等
xuantianyixiao
这个作者很懒,什么都没留下…
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10x loupe browser 筛选样品细胞群
loupe browser 的使用,文件格式原创 2022-11-27 16:20:20 · 452 阅读 · 0 评论 -
upset plot
1. upset 概述upset展现多个数据集合的交互关系的图形,类似于传统的venn图数据输入格式:list(set1=c(), set2=c()),通过字符UpSetR会自动算出交集;另外可以写成0和1的矩阵,0代表不存在,1,代表存在,在矩阵中看不同子集的共有元素情况。此外,list可以通过list_to_matrix函数转化为矩阵形式。2. Upset modemode有三种模式,distinct:常用的,理解为venn形式的;intersect:共有的,不考虑在余下数据集中是否有;uni原创 2021-09-05 18:33:41 · 816 阅读 · 0 评论 -
ComplexHeatmap学习笔记和总结
ComplexHeatmap学习笔记和总结声明:本文档是在学习ComplexHeatmap和测试例子过程中,相关方法的小结,方便回顾查看,快速实现数据可视化,理解错误之处,欢迎批评指正1. ComplexHeatmap总览ComplexHeatmap软件包主要用来展现热图,常说的热图包括,body和components(title, dendrograms, matrix names 和热图注释(放在热图旁,该可根据注释组合不同的复杂图形)。heatmap body部分可以根据行和列分割。整体原创 2021-09-05 17:54:57 · 2714 阅读 · 0 评论