caimaid安装:创建实例错误

在尝试使用CATMAID时,使用`./manage.py catmaid_insert_example_projects --user=1`命令创建实例失败。错误涉及Python的h5py和NeuroML库。解决方法包括更改pip源为国内地址以避免安装库时的超时问题,以及正确安装名为`neuroml`的库。完成安装后,重新运行初始命令,问题得以解决。
摘要由CSDN通过智能技术生成

1. If you want to have some example projects to try in your new CATMAID instance, you can create a couple with the
following command:

./manage.py catmaid_insert_example_projects --user=1

结果运行失败了, 虽然没说是错误, 但是确实是运行失败

(catmaid) bibao@ubuntu:~/catmaid/django/projects$ ./manage.py catmaid_insert_example_projects --user=1
INFO 2018-06-29 10:38:25,581 CATMAID was unable to load the h5py library, which is an optional dependency. HDF5 tiles are therefore disabled. To enable, install h5py.
WARNING 2018-06-29 10:38:25,836 NeuroML module could not be loaded.

2. 这里出现了两个错误一个是不能假再h5py 一个是不能加载NeuroML.

其实这两个都是python的一个第三方库.直接安装就好

pip install h5py

可以直接安装这个库, 当然如果pip镜像没修改的话,可以直接改为国内地址,否则容易超时或者耗时长.

mkdir ~/.pip
vim ~/.pip/pip.conf
写入下面信息即可
[global]  
index-url=http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple
[install]
trusted-host=mirrors.aliyun.com  
disable-pip-version-check = true  
timeout = 6000

3. 安装完后需要安装NeuroML,这个库的名字不是这个, 需要修改一下.

通过看官方

可以指导命令如下:

pip install pyneuroml

运行后<

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