近红外干货 | NIRS_SPM单被试激活分析过程

       今天给大家整理了基于NIRS_SPM近红外一阶分析中单被试的激活分析过程~对于近红外课程感兴趣的朋友可以点击下面这条链接了解详情

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NIRS_SPM单被试激活分析的过程主要包括下面这几个步骤

  1. 格式转换

  2. 通道定位

  3. 一阶分析:声明模型信息

  4. 估计模型参数

  5. 查看结果

在讲解具体操作前,我们先确认一下我们的操作环境。

Matlab版本:2013b(不要用太新的,不确定会不会有bug)

SPM版本:SPM8

NIRS_SPM

一、格式转换

不同的近红外设备采集的信号存储格式迥异,在用MATLAB分析前需要对数据格式进行标准化。也就是说要把数据格式转换成MATLAB能够识别的.mat文件,转换完的文件必须包含频率、通道、脱氧血红蛋白、氧合血红蛋白、总血红蛋白这五个数据。

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下面讲解下具体的数据转换的流程:

(1)慧创数据格式转换:

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NIRS_SPM并没有提供慧创近红外数据格式转换的功能,慧创的HC_Calculate示例脚本提供了数据格式转换参考,大家可以找我们的工程师 MCKJ-zhouyi 或 17373158786 索要哦~

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(2)使用NIRS_SPM对数据进行格式转换

Matlab命令框输入NIRS_SPM,弹出界面,找到Convert

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示例:

岛津数据转换(shimadzu):原始数据为txt文件

依次点击如下

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显示加载进度

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直到弹出显示采样频率的界面,再点击save,选择好文件的保存路径,这时候就完成了数据转换。

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日立数据转换(HITACHI):日立的数据主要由csv文件组成

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点击load后,依次加载氧合血红蛋白浓度,脱氧血红蛋白浓度,总血氧蛋白浓度,完成后出现如下结果,再点击保存。

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NIRS数据转换

先导入通道信息再导入数据信息,最后保存save

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2、通道定位

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再点击Project MNI Coordinate toRendered Brain才会弹出通道定位图,再点击OK。

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弹出:

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直到下图出现表示通道定位完成。

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保存通道定位好的文件。

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3、一阶分析:声明模型信息

我们只做个体水平的分析,选择Specify st Level。

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这里只分析氧合血红蛋白浓度所以就只选Oxy-Hb就可以,如果你想分析脱氧的可以点选Deoxy-Hb。

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下面弹出的界面参数设置一般点选下列选项就可以了。

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下面需要根据自己的实验范式填写参数。

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  最后会弹出一阶分析的结果。

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在结果路径会生成:

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4、估计模型参数

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结果文件:

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5、查看结果

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4设置对比矩阵

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得到激活图

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篇幅有限,

想要进一步学习近红外相关知识的朋友,欢迎了解我们茗创科技的近红外课程,可联系工程师

MCKJ-zhouyi 或 17373158786 进行咨询哦~

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