今天给大家整理了基于NIRS_SPM近红外一阶分析中单被试的激活分析过程~对于近红外课程感兴趣的朋友可以点击下面这条链接了解详情
NIRS_SPM单被试激活分析的过程主要包括下面这几个步骤
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在讲解具体操作前,我们先确认一下我们的操作环境。
Matlab版本:2013b(不要用太新的,不确定会不会有bug) SPM版本:SPM8 NIRS_SPM |
一、格式转换
不同的近红外设备采集的信号存储格式迥异,在用MATLAB分析前需要对数据格式进行标准化。也就是说要把数据格式转换成MATLAB能够识别的.mat文件,转换完的文件必须包含频率、通道、脱氧血红蛋白、氧合血红蛋白、总血红蛋白这五个数据。
下面讲解下具体的数据转换的流程:
(1)慧创数据格式转换:
NIRS_SPM并没有提供慧创近红外数据格式转换的功能,慧创的HC_Calculate示例脚本提供了数据格式转换参考,大家可以找我们的工程师 MCKJ-zhouyi 或 17373158786 索要哦~
(2)使用NIRS_SPM对数据进行格式转换
Matlab命令框输入NIRS_SPM,弹出界面,找到Convert
示例:
岛津数据转换(shimadzu):原始数据为txt文件
依次点击如下
显示加载进度
直到弹出显示采样频率的界面,再点击save,选择好文件的保存路径,这时候就完成了数据转换。
日立数据转换(HITACHI):日立的数据主要由csv文件组成
点击load后,依次加载氧合血红蛋白浓度,脱氧血红蛋白浓度,总血氧蛋白浓度,完成后出现如下结果,再点击保存。
NIRS数据转换
先导入通道信息再导入数据信息,最后保存save
2、通道定位
再点击Project MNI Coordinate toRendered Brain才会弹出通道定位图,再点击OK。
弹出:
直到下图出现表示通道定位完成。
保存通道定位好的文件。
3、一阶分析:声明模型信息
我们只做个体水平的分析,选择Specify st Level。
这里只分析氧合血红蛋白浓度所以就只选Oxy-Hb就可以,如果你想分析脱氧的可以点选Deoxy-Hb。
下面弹出的界面参数设置一般点选下列选项就可以了。
下面需要根据自己的实验范式填写参数。
最后会弹出一阶分析的结果。
在结果路径会生成:
4、估计模型参数
即
结果文件:
5、查看结果
4设置对比矩阵
得到激活图
篇幅有限,
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