茗创:脑电数据处理业务

文章来源于微信公众号(茗创科技),欢迎有兴趣的朋友搜索关注。

01

数据预处理

好的数据质量是获得可靠结果的前提,而预处理的质量往往对后处理的结果存在一定的影响。脑电的数据对噪音的敏感性很强,为了提高您数据的质量,在更大程度上将数据中的信噪比提高,获得更严谨的科研结果,我们会对您的数据进行高质量的预处理。

主要包括:电极定位、滤波、降采样、分段、手动去除伪迹分段、坏电极替换、通过 ICA 的方式进行伪迹校正、使用极端值的方法去除伪迹分段、重参考等。

 

02

任务态数据时域分析

  • 时域指标提取
  • 对 ERP 数据按照刺激类型进行叠加平均,并按照感兴趣的时间窗和通道提取成分特征,如:峰值、潜 伏期、平均振幅等指标,也可以对 ERP 成分进行进一步的主成分分析(PCA)、独立成分分析(ICA)
  • 统计分析
  • 根据客户的实验设计,选择合适的方法对提取的特征进行统计分析,包括:T 检验,包括单样本 T 检 验、双样本 T 检验、配对 T 检验等;方差分析(ANOVA),包括单因素方差分析、重复测量方差分析、双因素方差分析、多因素方差分析等。
  • 也可以根据给定的感兴趣通道,对数据沿着时间进行点对点的统计分析,找出差异显著的时间范围;或者根据感兴趣的时间范围,对数据沿着通道进行分析,找出存在显著差异的通道。
  • 多重比较校正,包括:cluster-based 置换检验、FWE、FDR 校正等。
  • 结果可视化
  • 绘制组平均波形图、地形图等。

03

静息态数据频域/任务态数据时频域分析

  • 频域/时频域指标提取
  • 通过快速傅里叶变换(FFT)、短时傅里叶变换(STFT)、小波变换(CWT)等方式,将时域的信号转 换为频域/时频域信号,依据感兴趣频段/时间段提取静息态数据的幅值(uV、uV2、PSD(dB))以及任务态 的 ERD、ERS 等指标。
  • 统计分析
  • 根据客户的实验设计,选择合适的方法对提取的特征进行统计分析,包括:T 检验,包括单样本 T 检 验、双样本 T 检验、配对 T 检验等;方差分析(ANOVA),包括单因素方差分析、重复测量方差分析、双因 素方差分析、多因素方差分析等。
  • 对于 EEG 数据的频域分析,可以根据给定的感兴趣通道,对数据沿着不同的频段进行统计分析,找出 存在差异显著的频段;或根据感兴趣的频段,沿着通道进行分析,找出存在显著差异的通道。
  • 对于 ERP 数据的时频域分析,可以根据感兴趣的时间,沿着不同的频段进行统计分析,找出存在显著 差异的频段;或根据感兴趣的频段,沿着不同的时间点进行统计分析,找到存在显著差异的时间范围。或 者根据感兴趣的时间范围、频段范围,沿着通道进行分析,找出存在显著差异的通道。
  • 多重比较校正,包括:cluster-based 置换检验、FWE、FDR 校正等。
  • 结果可视化
  • 绘制组功率谱图、时频图、地形图等。

04

溯源分析

  • 源信号提取
  • 通过 sLORETA、fieldtrip、Besa 等软件,对静息态数据/任务态数据进行溯源分析。也可以根据被试 的 MRI 结构像,对每个被试创建个体水平的头模,从而进行更精确的溯源分析,找到不同频段/时间段中激活存在显著差异的脑区。脑区信号可根据给定的 MNI 空间坐标或 AAL116、AAL90、BA 等模板提取。
  • 统计分析
  • 根据客户的实验设计,选择合适的方法对提取的特征进行统计分析,包括:T 检验,包括单样本 T 检 验、双样本 T 检验、配对 T 检验等;方差分析(ANOVA),包括单因素方差分析、重复测量方差分析、双因 素方差分析、多因素方差分析等。
  • 多重比较校正,包括:cluster-based 置换检验、FWE、FDR 校正等。
  • 结果可视化
  • 绘制激活图等。

05

功能连通性分析

  • 功能连通性指标提取
  • 1)通道水平的功能连通性分析
  • 根据给定的感兴趣频段/时间段,对通道进行功能连通性指标计算,包括但不限于:皮尔逊相关(COR)、相干(COH)、相位锁值(PLV)、相位延迟指数(PLI)、加权相位延迟指数(wPLI),以及格兰杰因果(GC)等。
  • 2)源水平的功能连通性分析
  • 根据溯源的结果,以及给定的 MNI 空间坐标或 AAL116、AAL90、BA 等模板提取脑区的信号,并计算功能连通性指标,包括但不限于皮尔逊相关(COR)、相干(COH)、相位锁值(PLV)、相位延迟指数(PLI)、加权相位延迟指数(wPLI),以及格兰杰因果(GC)等。
  • 统计分析
  • 根据客户的实验设计,选择合适的方法对提取的特征进行统计分析,包括:T 检验,包括单样本 T 检 验、双样本 T 检验、配对 T 检验等;方差分析(ANOVA),包括单因素方差分析、重复测量方差分析、双因 素方差分析、多因素方差分析等。
  • 多重比较校正,包括:FWE、FDR、NBS 校正等。

06

网络属性分析

  • 网络指标提取
  • 根据溯源后提取的脑区信号,计算脑区间的功能连接并进行网络构建,并基于图论计算网络属性指标, 包括但不限于:小世界属性(small world)、集聚系数(clustering coefficient)、全局效率(global efficiency)、节点效率(nodal efficiency)、节点局部效率(nodal local efficiency)以及节点度 中心性(nodal degree centrality)等。
  • 统计分析
  • 根据客户的实验设计,选择合适的方法对提取的特征进行统计分析,包括:T 检验,包括单样本 T 检 验、双样本 T 检验、配对 T 检验等;方差分析(ANOVA),包括单因素方差分析、重复测量方差分析、双因 素方差分析、多因素方差分析等。
  • 多重比较校正,包括:FWE、FDR 校正等。
  • 3.结果可视化
  • Bar 图、点线图、圈状图等。

07

跨频域耦合

  • ·CFC 指标提取
  • 通过快速傅里叶变换(FFT)、短时傅里叶变换(STFT)、小波变换(CWT)、希尔伯特变换(Hilbert)等方式,将时域的信号转换为频域/时频域信号,并提取相位、振幅等信息,进行 PPC(power-power coupling)、AAC(Amplitude-Amplitude coupling)以及 PAC(phase-power coupling-文献里用的最多)的 分析,指标包括但不限于:KL-MI、MVL-MI、PLV 等。
  • ·统计分析
  • 根据客户的实验设计,选择合适的方法对提取的特征进行统计分析,包括:T 检验,包括单样本 T 检 验、双样本 T 检验、配对 T 检验等;方差分析(ANOVA),包括单因素方差分析、重复测量方差分析、双因素方差分析、多因素方差分析等。
  • 多重比较校正,包括:FWE、FDR 校正等。
  • ·结果可视化

图7.跨频域耦合

08

微状态分析

  • 微状态指标提取
  • 通过 K-means/AAHC 等方法对地形图进行聚类分析,将 EEG/ERP 数据划分为微状态 A、B、C、D 这四个主要类别并提取平均持续时间(average duration or lifespan)、出现频率(frequency)、覆盖范围(coverage)、转换概率等指标。
  • 统计分析
  • 根据客户的实验设计,选择合适的方法对提取的特征进行统计分析,包括:T 检验,包括单样本 T 检 验、双样本 T 检验、配对 T 检验等;方差分析(ANOVA),包括单因素方差分析、重复测量方差分析、双因 素方差分析、多因素方差分析等。
  • 多重比较校正,包括:FWE、FDR 校正等。
  • 结果可视化

图8.微状态分析

 

09

无标度属性分析

1.无标度指标分析

很多研究表明, EEG 信号具有自仿射性,且其时间序列具有长程时域相关(long-range temporal correlations, LRTC)。根据数据的特征可以提取:去趋势波动分析(DFA)、waiting time、life time 等指标。

2.统计分析

根据客户的实验设计,选择合适的方法对提取的特征进行统计分析,包括:T 检验,包括单样本 T 检 验、双样本 T 检验、配对 T 检验等;方差分析(ANOVA),包括单因素方差分析、重复测量方差分析、双因素方差分析、多因素方差分析等。

多重比较校正,包括:FWE、FDR 校正等。

3.结果可视化

根据不同的指标,绘制相应的结果图。

图9.无标度属性分析

10

定制化分析

  • 分析方法可定制。
  • 茗创科技可根据您提供的模板文献,基于您的实验数据,实现文献中使用的数据分析方法。此外,未列出的分析方法,只要在茗创科技的能力范围内,尽力实现您的想法。
  • 分析代码可定制。
  • 在没有现有的软件适用于您的数据分析需求时,茗创科技会与您协商,通过编写代码实现您的想法,并提供代码的完整实现。


茗创科技专注于脑科学数据处理,涵盖(EEG/ERP,fMRI,结构像,DTI,ASL,FNIRS)等,欢迎留言讨论及转发推荐,也欢迎了解茗创科技的脑科学课程,数据处理服务及脑科学工作站销售业务,可添加周翊工程师(微信号MCKJ-zhouyi17373158786)咨询。


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