智能优化算法：生物地理学优化算法-附代码

智能优化算法：生物地理学优化算法-附代码

摘要：Alfred Wallace和Charles Darwin在19世纪提出了生物地理学理论，研究生物物种栖息地的分布、迁移和灭绝规律。Simon受到生物地理学理论的启发，在对生物物种迁移数学模型的研究基础上，于 2008年提出了一种新的智能优化算法 — 生物地理学优化算法（Biogeography-Based Optimization，BBO）。BBO算法是一种基于生物地理学理论的新型算法，具有良好的收敛性和稳定性，受到越来越多学者的关注。

1.算法原理

BO算法的基本思想来源于生物地理学理论。如图1所示，生物物种生活在多个栖息地（Habitat）上，每个栖息地用栖息适宜指数（Habitat Suitability Index，HSI）表示，与HSI相关的因素有降雨量、植被多样性、地貌特征、土地面积、温度和湿度等，将其称为适宜指数变量（Suitability Index Variables，SIV）。

图1.BBO算法中的多个栖息地

HSI是影响栖息地上物种分布和迁移的重要因素之一。较高 HSI的栖息地物种种类多；反之，较低 HSI的栖息地物种种类少。可见，栖息地的HSI与生物多样性成正比。高 HSI的栖息地由于生存空间趋于饱和等
问题会有大量物种迁出到相邻栖息地，并伴有少量物种迁入；而低 HSI的栖息地其物种数量较少，会有较多物种的迁入和较少物种的迁出。但是，当某一栖息地HSI一直保持较低水平时，则该栖息地上的物种会趋于灭绝，或寻找另外的栖息地，也就是突变。迁移和突变是BBO算法的两个重要操作。栖息地之间通过迁移和突变操作，增强物种间信息的交换与共享，提高物种的多样性。

BBO算法具有一般进化算法简单有效的特性，与其他进化算法具有类似特点。
（1）栖息适宜指数HSI表示优化问题的适应度函数值，类似于遗传算法中的适应度函数。HSI是评价解集好坏的标准。
（2）栖息地表示候选解，适宜指数变量 SIV 表示解的特征，类似于遗传算法中的“基因”。

（3）栖息地的迁入和迁出机制提供了解集中信息交换机制。高 HSI的解以一定的迁出率将信息共享给低HSI的解。
（4）栖息地会根据物种数量进行突变操作，提高种群多样性，使得算法具有较强的自适应能力。

BBO算法的具体流程为：
步骤1 初始化BBO算法参数，包括栖息地数量$N$、迁入率最大值$I$和迁出率最大值$E$、最大突变率 $m_{max}$ 等参数。
步骤2 初始化栖息地，对每个栖息地及物种进行随机或者启发式初始化。
步骤3 计算每个栖息地的适宜指数HSI；判断是否满足停止准则，如果满足就停止，输出最优解；否则转步骤4。
步骤4 执行迁移操作，对每个栖息地计算其迁入率和迁出率，对SIV进行修改，重新计算适宜指数HSI。
步骤5 执行突变操作，根据突变算子更新栖息地物种，重新计算适宜指数HSI。
步骤6 转到步骤3进行下一次迭代。

1.1 迁移操作

如图2所示，该模型为单个栖息地的物种迁移模型。

图2.BBO算法的迁移模型

横坐标为栖息地种群数量 S ，纵坐标为迁移比率 η，λ(s) 和 μ(s) 分别为种群数量的迁入率和迁出率。当种群数量为 0 时，种群的迁出率 μ(s) 为 0，种群的迁入率λ(s) 最大；当种群数量达到 S max 时，种群的迁入率 λ(s)为0，种群迁出率 u(s) 达到最大。当种群数量为 S 0 时，迁出率和迁入率相等，此时达到动态平衡状态。根据图2，得出迁入率和迁出率为：
$$\{\begin{array}{l}\lambda (s)=I(1-S/S_{max})\\ u(s)=ES/S_{max}\end{array}\text{\hspace{1em}(1)}$$
迁移操作的步骤可以描述为：
Step1：for i= 1 to N do
Step2： 用迁入率${\lambda }_i$ 选取$x^j$

Step3： if （0，1）之间的均匀随机数小于${\lambda }_i$ then
Step4： for j= 1 to N do
Step5： 用迁出率 $u_i$ 选取$x_j$
Step6： if （0，1）之间的均匀随机数小于 $u_i$ then
Step7： 从 $x^j$中随机选取一个变量SIV
Step8： 用SIV替换$x^i$中的一个随机SIV
Step9： end if
Step10： end for
Step11： end if
Step12：end for

1.2 突变（Mutation）操作

突变操作是模拟栖息地生态环境的突变，改变栖息地物种的数量，为栖息地提供物种的多样性，为算法提供更多的搜索目标。栖息地的突变概率与其物种数量概率成反比。即
$$m_s=m_{max}(1-P_s/P_{max})\text{\hspace{1em}(2)}$$
其中： $m_{max}$ 为最大突变率； $P_s$ 为栖息地中物种数量为 $s$对应的概率； $P_{max}$ 为 $P_s$ 的最大值； $m_s$ 是栖息地中物种数量为 $s$对应的突变概率。

突变操作的步骤可以描述为：
Step1：for i= 1 to N do
Step2： 计算突变概率 $P_s$
Step3： 用突变概率 $P_s$ 选取一个变量 $x_i$
Step4： if （0，1）之间的均匀随机数小于 $m_s$ then
Step5： 随机一个变量代替 $x^i$ 中的SIV
Step6： end if
Step7：end for

2.算法结果

3.参考文献

[1] Simon D.Biogeography-based optimization[J].IEEE Trans-
actions on Evolutionary Computation，2008（6）：702-713.

[2]张国辉,聂黎,张利平.生物地理学优化算法理论及其应用研究综述[J].计算机工程与应用,2015,51(03):12-17.

4.Matlab代码

生物地理学优化算法
算法相关应用

名称	说明或者参考文献
生物地理学优化的BP神经网络（预测）	https://blog.csdn.net/u011835903/article/details/112149776（原理一样，只是优化算法用生物地理学优化算法）
基于共生生物算法的无线传感器网(WSN)覆盖优化	https://blog.csdn.net/u011835903/article/details/109262039（原理一样，只是优化算法用生物地理学优化算法）
基于共生生物算法的3D无线传感器网(WSN)覆盖优化	https://blog.csdn.net/u011835903/article/details/113834323（原理一样，只是优化算法用生物地理学优化算法）

5.python代码

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