DNA序列

最新推荐文章于 2024-08-31 14:07:39 发布
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分类专栏： 算法题目 文章标签： 算法 acm
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给定m个长度为n的DNA序列，目标是找到一个DNA序列，使得其与所有给定序列的Hamming距离之和最小。文章讨论如何求解这一问题，并给出实例解释。例如，在一个特定案例中，最优解是TAAGCTAC。
摘要由CSDN通过智能技术生成

输入m个长度为n的DNA序列，求一个DNA序列，到所有序列的总的Hamming距离尽量小，两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数，例如，ACGT和GCGA的Hamming距离为2（左数第1，4个字符不同）。

输入整数m和n（4<=m<=50,4<=n<=1000）,以及m个长度为m的DNA序列（只包含字母A,C,G,T），输出到m个序列的Hamming距离和最小的DNA序列和对应的距离。如有多解，要求为字典序最小的解。例如，对于下面5个DNA序列，最优解为TAAGCTAC。

TATGATAC

TAAGCTAC

AAAGATCC

TGAGATAC

TAAGATGT

#include<st
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重复的DNA序列_C++_DNA_
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求最小Hamming距离的DNA序列
X丶 的博客
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用DNA取代硬盘
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为什么重要： 随着数字化信息量的增长，如何找到可靠的长期存储介质逐渐成为一大问题。   有朝一日，DNA的作用可能不只是生命的蓝图，还可能以不可想象的压缩形式将大量的文档、音乐或图片储存几千年之久。   位于英国辛克斯顿的欧洲生物信息学研究所的研究人员展示了一种新方法，能够用这种方式对几种常见的计算机文件格式进行可靠编码。随着DNA测序和合成的价格持续下降，研究人员估计，DNA这种生物存
生物信息学：DNA序列的构成 与易经
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belldeep的专栏
08-31 354
DNA序列的构成基于四种特定的碱基，分别是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、鸟嘌呤（G）和胞嘧啶（C）。
DNA序列排序
weixin_55799469的博客
03-20 859
一个序列中的“未排序”的度量是相对于彼此顺序不一致的条目对的数量，例如，在字母序列“DAABEC”中，该度量为5，因为D大于右边是4个字母，E大于其右边的1个字母。该度量称为该序列的逆序数。序列“AACEDGG”只有一个逆序对（E和D），它几乎被排序好了，而序列“ZWQM”有6个逆序对，它是未排序的，恰好是反序。你需要对若干个DNA序列（仅包含4个字母A、C、G和T的字符串）分类，注意是分类而不是按字母顺序排序，而是按照“最多排序”到“最小排序”的顺序排列，所有DNA序列的长度都相同。
最多排序到最少排序（分治法）
假技术Po主
04-23 2960
一.程序题（共1题,100.0分） 1、在线编程题4．求解按“最多排序”到“最少排序”的顺序排列问题 【问题描述】一个序列中的“未排序”的度量是相对于彼此顺序不一致的条目对的数量，例如，在字母序列“DAABEC”中该度量为5，因为D大于其右边的4个字母，E大于其右边的1个字母。该度量称为该序列的逆序数。序列“AACEDGG”只有一个逆序对(E和D)，它几乎被排好序了，而序列“ZWQM”有6个逆序对，它是未排序的，恰好是反序。 需要对若干个DNA序列（仅包含4个字母A、C、G和T的字符串）分类，注意是分类而不
DNA序列（DNA Consensus String, ACM/ICPC Seoul 2006, UVa1368）
小wal的博客
02-15 434
问题描述： 输入m个长度均为n的DNA序列，求一个DNA序列，到所有序列的总Hamming距离尽量 小。两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数，例如，ACGT和GCGA的 Hamming距离为2（左数第1, 4个字符不同）。 输入整数m和n（4≤m≤50, 4≤n≤1000），以及m个长度为n的DNA序列（只包含字母 A，C，G，T），输出到m个序列的Hamming距离和最小的...
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10-14
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11-13
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DNA序列 (DNA Consensus String, ACM/ICPC Seoul 2006 UVa1368)
sunlanchang的博客
01-20 1888
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1.DNA序列
zj0910
11-08 2232
一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例（定义为GC-Ratio）是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。 给定一个很长的DNA序列，以及要求的最小子序列长度，研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。
习题3-7 DNA序列
cprimesplus的博客
10-31 2234
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理解adb错误：Can‘t find service: android.service.gatekeeper.IGateKeeperService
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【算法设计与分析(课后答案)】二分
丧心病狂Loli控的博客
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DNA序列分析与基因芯片分类研究
"DNA序列分析是生物信息学的重要研究领域，主要关注如何处理和理解大量的生物序列数据。在本文中，作者曾诚探讨了DNA序列的图形表示方法和序列相似性分析，提出了一种基于核苷酸二联体的表示法。此外，还详细介绍了...
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