Cython学习笔记和例程

Chapter2 ：Compiling and Running Cython Code

编译运行Cython代码有好几种方式，没有必要全部掌握，可以根据需要选择合适的方式。这里例举了3种常见方式，基本也够用了。一般方法3创建setup.py是最基础的，自由度也最高

1.  使用Ipython进行cython函数的互动编译和使用，适合原型调试

2.使用pyximport可以直接import使用，import时会自动编译，使用比较方便。

#fib.pyx
import cython

def fib(int n):
    cdef int i
    cdef double a=0.0,b=1.0
    for i in range(n):
        a,b =a+b,a
    return a

# main.py
import pyximport
pyximport.install()
import fib
res = fib.fib(90)

3.常规的编译方法，使用setuptool或distutils库。这种方式可以把cython部分代码编译成动态连接库，方便部署和源码的加密隐藏。

# setup.py
from setuptools import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(
    ext_modules=cythonize(["fib.pyx"],annotate=True)
)

 执行下面命令,会生成一个fib*.so的动态链接库文件

python setup.py build_ext --inplace
'''
执行结果大致如下
running build_ext
building 'fib' extension
creating build
creating build/temp.linux-x86_64-3.8
gcc -pthread -B /home/a/miniconda3/compiler_compat -Wl,--sysroot=/ -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/home/a/miniconda3/include/python3.8 -c fib.c -o build/temp.linux-x86_64-3.8/fib.o
creating build/lib.linux-x86_64-3.8
gcc -pthread -shared -B /home/a/miniconda3/compiler_compat -L/home/a/miniconda3/lib -Wl,-rpath=/home/a/miniconda3/lib -Wl,--no-as-needed -Wl,--sysroot=/ build/temp.linux-x86_64-3.8/fib.o -o build/lib.linux-x86_64-3.8/fib.cpython-38-x86_64-linux-gnu.so
copying build/lib.linux-x86_64-3.8/fib.cpython-38-x86_64-linux-gnu.so -> 
'''

# main.py
import fib
res = fib.fib(90)

Chapter3 ：Cython in Depth

1.带有cdef的静态类型声明

# 声明方式1
cdef int i
cdef int j
cdef float k
j=0
i=j
k=12.0
j=2*k
assert i!=j

# 声明方式2
cdef int i,j,k
cdef float price,margin

# 声明方式3
cdef int i=0
cdef long int j=0,k=0
cdef float price=0.0,margin=1.0


# 其他cdef的表达式
#1）C指针
cdef int *p 
cdef void **buf

#2）Stack-allocated C arrays(C数组)
cdef int arr[10]
cdef double points[20][30]

#3）其他可用类型
cdef size_t len

#4）结构体和集合
cdef tm time_struct
cdef int_short_union_t hi_log_bytes

#4）函数指针
cdef void (*f)(int,double)

2.Cython的自动类型推断(不推荐）

cimport cython

@cython.infer_types(True)
def more_inference():
    i = 1
    d = 2.0
    c = 3+4*j
    r = i*d +c
    return r

3.Cython中的C指针

cdef double golden_ratio
cdef double *p_double
p_double = &golden_ratio
p_double[0] =1.618
print(golden_ratio)
# =>1.618
print(p_double[0])
# =>1.618

cython使用结构体用’.'访问，而不需要使用’->',在转成C语言时会自动转换

# C语言写法示例
cdef st_t *ps_t = make_struct()
cdef int a_doubled = ps_t->a+ps_t->a

#cython写法
cdef st_t *ps_t = make_struct()
cdef int a_doubled = ps_t.a+ps_t.a

4.静态和动态类型变量的混合

cdef list particles,modified_particles
cdef dict names_from_particles
cdef str pname
cdef set unique_particles

particles = list(names_from_particles.keys())
other_particles = particles
del other_particles[0]