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原创 GROMACS运行参数之em.mdp文件详解
GROMACS(5.1.4)教程:蛋白质配体复合物官网:点击打开链接李老师博客:点击打开链接蛋白质配体复合物模拟添加离子过程中需要用到输入文件em.mdp,现对里面的各种编辑项目做简单注释。###em.mdp###; LINES STARTING WITH ';' ARE COMMENTStitle = Minimization ; Titl...
2017-09-27 20:03:15 6170
原创 Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装RDkit
RDKit: Open-Source Cheminformatics Software点击打开链接RDKit安装包下载:点击打开链###########################################################################安装boost库python2 -m pip install boost #视自...
2017-09-20 23:24:02 4186
原创 Win10下MySQL_Workbench连接远程主机MySQL5.7
创建用户grant all privileges on *.* to 远程访问用户名@'%' identified by '密码';显示用户select host,user from user;删除用户drop user AspirinCode@'%';flush privileges;
2017-09-17 22:47:20 3653 1
原创 Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装ACPYPE
ACPYPE,基于Python的工具,使用Antechamber生成化学化合物的拓扑,并提供python与其他应用程序的接口。将AMBER力场文件转换为GROMACS的拓扑文件。acpype安装包下载svn checkout http://ccpn.svn.sourceforge.net/svnroot/ccpn/branches/stable/ccpn/python/acpy...
2017-09-10 23:44:39 5425 1
原创 Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装DOCK6.8
DOCK6 是UCSF(加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接的软件。用于学术研究目的DOCK6 官网申请,申请时需要填写真实详细的信息(学校名称、网站地址、导师名称等等)。官网点击打开链接分子对接软件DOCK6.8的安装安装依赖yum install gcc yum install gcc-c++ yum install ...
2017-09-10 18:16:56 4369 6
原创 OpenBabel2.4.1转换mol2格式到pdbqt格式
OpenBabel2.4.1转换mol2格式到pdbqt格式实例:obabel -imol2 FragmentLibrary.mol2 -opdbqt -O FragmentLibrary.pdbqtDrugAI
2017-09-09 12:22:48 8553 8
RDKit Documentation Release 2019.09.1.pdf
2019-12-26
基于神经网络的溶解度预测和回归分析的数据集文件
2018-09-16
pymol-2.1.0-cp36-cp36m-win
2018-05-18
2017-Bioinformatics-Volume II- Structure, Function, and Applications
2018-05-18
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