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RSS订阅原创 16s扩增子 qiime2 实战
qiime2的安装服务器上的安装启用qiime环境sudo suconda info --envsconda activate qiime2-2020.11关闭环境conda deactivate安装fastqc multiqc# fastqcconda install -c bioconda fastqc -y# multiqcpip install multiqc参考博客：扩增子分析流程详细版16s数据分析流程1 下载文件转换sra或者.1文件转fastqfa
2021-03-03 13:16:42
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原创 sra、fastq等文件的数据库下载
aspera测试下载命令ascp -l 100M -P 33001 -QT -k 2 -i /root/miniconda3/envs/qiime2-2020.11/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR576/004/SRR5760814/SRR5760814.fastq.gz ./test.fq.gz下载速度能有56.7Mb/s 非常令人感动了文件最后的保存地址是ubuntu默认下载文件
2021-01-29 01:13:17
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空空如也
空空如也
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