数字图像处理-编程实现染色体计数 C语言实现

这篇博客介绍了如何使用C语言进行数字图像处理,实现染色体的自动计数。主要内容包括图像的读取、灰度转换、平滑滤波、二值化、膨胀、腐蚀等处理步骤,最终通过统计连通区域数量得出染色体计数。代码已展示。
摘要由CSDN通过智能技术生成

调用的框架:http://blog.chinaunix.net/uid-20622737-id-3173056.html
实验内容:
对于下面这幅图像,编程实现染色体计数,并附简要处理流程说明。
这里写图片描述
处理步骤:
1. 读取图像,转换为灰度图像

  1. 平滑滤波去噪

  2. 图像二值化

  3. 对图像进行膨胀

  4. 再次膨胀(视情况而定)

  5. 腐蚀(视情况而定)

  6. 反转

  7. 统计连通区域个数并输出

  8. 保存图像。

void main()
{
    Bitmap *bmp = (Bitmap *)malloc(sizeof(Bitmap));// build an empty bmp to put the img.空变量呈放图片
    Bitmap *dstBmp = (Bitmap *)malloc(sizeof(Bitmap));
    Bitmap *graybmp = (Bitmap *)malloc(sizeof(Bitmap));
    Bitmap *smoothbmp = (Bitmap *)malloc(sizeof(Bitmap));
    Bitmap *binbmp = (Bitmap *)malloc(sizeof(Bitmap));
    Bitmap *temp = (Bitmap *)malloc(sizeof(Bitmap));
    int ret;
    char *path ="C:\\Users\\Ali\\Desktop\\1.bmp";
    ret = ReadBitmap(path, bmp);//读取图片
    char *savePath ="C:\\Users\\Ali\\Desktop\\zuizhong.bmp";
    RGB2Gray(bmp,graybmp);//转换成灰度图
    smooth(graybmp,smoothbmp);
    Gray2BW(smoothbmp,binbmp,155);//二值化
    pengzhang(binbmp, dstBmp);  
    pengzhang(dstBmp, temp);
    fushi(temp,dstBmp);
    qufan(dstBmp,temp);
    /*BYTE *bitmap = temp->imageData;
    int width = temp->width;
    int height = temp->height;
    int *labelmap;
    ConnectedComponentLabeling(bitmap, width, height,labelmap); 有待调整 此处是调用本博客的另一篇文章
    二值图像统计连通区域*/
    SaveBitmap(savePath,temp);//保存图片    
}

bmp.h

#ifndef BMP_H_INCLUDED
#define BMP_H_INCLUDED

#include <ctype.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <malloc.h>
#include <string.h>

/**
 * 位图文件结构及基本函数定义  打开和保存bmp文件
 */
typedef unsigned short WORD;
typedef unsigned long DWORD;
typedef long LONG;
typedef unsigned char BYTE;

/* 位图文件头结构 14字节 */
typedef struct tagBITMAPFILEHEADER {
    WORD bfType;
    DWORD bfSize;
    WORD bfReserved1;
    WORD bfReserved2;
    DWORD bfOffBits;
} BITMAPFILEHEADER;

/* 位图信息头结构 40字节 */
typedef struct tagBITMAPINFOHEADER {
    DWORD biSize; // 结构长度 40B
    LONG biWidth;
    LONG biHeight;
    WORD biPlanes; // 1
    WORD biBitCount; // 表示颜色要用到的位数
    DWORD biCompression; // 压缩格式
    DWORD biSizeImage; // 位图占用字节数=biWidth'(4的整倍数)*biHeight
    LONG biXPelsPerMeter; // 水平分辨率
    LONG biYPelsPerMeter; // 垂直分辨率
    DWORD biClrUsed; // 本图像用到的颜色数
    DWORD biClrImportant; // 本图像的重要颜色数
} BITMAPINFOHEADER;

/* 调色板 4字节 */
typedef struct tagRGBQUAD {
    BYTE rgbBlue;
    BYTE rgbGreen;
    BYTE rgbRed;
    BYTE rgbReserved;
} RGBQUAD;

/* 定义图像信息 */
typedef struct tagBITMAPINFO {
    BITMAPINFOHEADER bmiHeader;
    RGBQUAD bmiColors[1];
} BITMAPINFO;

/* 定义位图图像 */
typedef struct _Bitmap
{
    BITMAPFILEHEADER bmfh;
    BITMAPINFOHEADER bmih;
    int width;
    int height;
    int bitCount;    // 8 或者24
    int imageSize;    // 图像数据大小(imageSize=height*widthStep)字节
    BYTE* imageData;//排列的图像数据
    int widthStep;    //排列的图像行大小
}Bitmap;

/**
 * 位图创建函数  创建一个Bitmap结构,并为图像数据分配空间
 *
 * 使用方法:
 *     Bitmap *bmp=(Bitmap*)malloc(sizeof(Bitmap));
 *     ret=CreateBitmap(bmp,50,50,3);
 */
int CreateBitmap(Bitmap* bmp, int width, int height, int bitCount)
{
    bmp->width=width;
    bmp->height=height;
    bmp->bmih.biWidth=width;
    bmp->bmih.biHeight=height;

    bmp->widthStep=(int)((width*bitCount+31)/32)*4;        //计算排列的宽度
    bmp->imageSize=bmp->height*bmp->widthStep*sizeof(BYTE);//计算排列的图像大小

    if(bitCount==8)
    {
        bmp->bitCount=8;
        bmp->bmfh.bfType=0x4d42;    //注意是4d42 这个地方折磨我一下午啊
        bmp->bmfh.bfReserved1=0;
        bmp->bmfh.bfReserved2=0;
        bmp->bmih.biBitCount=8;
        bmp->bmih.biSize=40;
        bmp->bmih.biPlanes=1;
        bmp->bmfh.bfSize=54+256*4+height*bmp->widthStep;
        bmp->bmfh.bfOffBits=1078;
        bmp->bmih.biBitCount=8;
        bmp->bmih.biCompression=0;
        bmp->bmih.biSizeImage=bmp->imageSize;
        bmp->bmih.biClrUsed=0;
        bmp->bmih.biClrImportant=0;
        bmp->bmih.biXPelsPerMeter=0;
        bmp->bmih.biYPelsPerMeter=0;
    }
    else if (bitCount==24)
    {
        bmp->bitCount=24;
        bmp->bmfh.bfType=0x4d42;
        bmp->bmih.biBitCount=24;
        bmp->bmfh.bfReserved1=0;
        bmp->bmfh.bfReserved2=0;
        bmp->bmih.biSize=40;
        bmp->bmih.biPlanes=1;
        bmp->bmfh.bfSize=54+height*bmp->widthStep;
        bmp->bmfh.bfOffBits=54;
        bmp->bmih.biBitCount=24;
        bmp->bmih.biSizeImage=bmp->imageSize;
        bmp->bmih.biClrUsed=0;
        bmp->bmih.biCompression=0;
        bmp->bmih.biClrImportant=0;
        bmp->bmih.biXPelsPerMeter=0;
        bmp->bmih.biYPelsPerMeter=0;
    }
    else
    {
        printf("Error(CreateBitmap): only supported 8 or 24 bits bitmap.\n");
        return -1;
    }

    bmp->imageData=(BYTE*)malloc(bmp->imageSize);        //分配数据空间
    if(!(bmp->imageData))
    {
        printf("Error(CreateBitmap): can not allocate bitmap memory.\n");
        return -1;
    }
    return 0;
}

/**
 * 位图指针释放函数  释放位图数据空间
 *
 * 使用方法:
 *     ReleaseBitmap(bmp);
 */
void ReleaseBitmap(Bitmap* bmp)
{
    free(bmp->imageData);
    bmp->imageData=NULL;
    free(bmp);
    bmp=NULL;
}

/**
 * 路径检查函数:是否为BMP文件,是否可读
 * 正确返回0,错误返回-1
 *
 * 使用方法
 *         ret=CheckPath(path);
 */
int CheckPath(char *path)
{
    FILE *fd;
    int len = strlen(path) / sizeof(char);
    char ext[3];
    //check whether the path include the characters "bmp" at end
    strncpy(ext, &path[len - 3], 3);
    if (!(ext[0] == 'b' && ext[1] == 'm' && ext[2] == 'p')) {
        printf("Error(CheckPath): the extension of the file is not bmp.\n");
        return -1;
    }

    //check whether the file can be read or not
    fd = fopen(path, "r");
    if (!fd)
    {
        printf("Error(CheckPath): can not open the file.\n");
        return -1;
    }
    fclose(fd);

    return 0;
}

/**
 * 从文件中读取位图de函数
 * 正确返回0,错误返回-1
 *
 * 使用方法:
 *     bmp=(Bitmap*)malloc(sizeof(Bitmap));
 *     ret=ReadBitmap(path, bmp);
 */
int ReadBitmap(char* path, Bitmap* bmp)
{
    int ret;
    FILE *fd;

    //检查路径是否可读
    ret=CheckPath(path);
    if(ret==-1)
    {
        printf("Error(ReadBitmap): the path of the image is invalid.\n");
        return -1;
    }

    //打开文件
    fd=fopen(path,"rb");
    if(fd==0)
    {
        printf("Error(ReadBitmap): can not open the image.\n");
        return -1;
    }

    //读取文件信息头     14字节
    fread(&(bmp->bmfh.bfType),sizeof(WORD),1,fd);
    fread(&(bmp->bmfh.bfSize),sizeof(DWORD),1,fd);
    fread(&
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