最清晰的conda安装与切换源教程（centos7.6）

1、下载

curl https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -o Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

2、安装

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b -p 安装路径

3、替换源

默认的源（国外）访问速度有些慢，增加清华的源，提高下载速度。

首先生成~/.condarc配置文件

conda config --set show_channel_urls yes

然后编辑~/.condarc文件，

channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch-lts: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
auto_activate_base: false   #修改默认不进入base环境

4、清除索引缓存

conda clean -i

这样安装与切换源就完成了，开始安装你所需要的环境或软件吧！

（conda create -n bowtie2 -c bioconda bowtie2=2.2.5）

参考：

anaconda | 镜像站使用帮助 | 清华大学开源软件镜像站 | Tsinghua Open Source Mirror

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