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原创 vscode 中的 Lammps Syntax Highlighting 插件

这个简直是编辑lammps脚本的神器集成了lammps command 的说明,read more直接打开command的说明。

2021-09-16 21:35:13 1676

原创 解决vscode下运行jupyter notebook时的no kernal的问题

找了各种解决办法,发现竟然是环境变量的设置问题

2020-04-12 13:29:35 2065 1

转载 [转]Ubuntu安装gcc,g++,gfortran

原文链接http://www.cnblogs.com/laishenghao/p/5342012.htmlhttp://blog.sina.com.cn/s/blog_6dd65c6f0100y793.html1.安装(1).gcc  ubuntu下自带gcc编译器。可以通过“gcc -v”命令来查看是否安装。(2).g++  安装g++编译器,可以通过命令“sudo apt-ge...

2019-04-19 15:46:28 5732

原创 VSCode中为code runner插件添加gfortran支持

首先当然是你已经安装了gfortran,并设置了相应的环境变量。在vscode的设置中找到code runner的设置选项图中1处Code-runner:Default Language添加fortranCode-runner:Executor Map 中点击在json中编辑添加gfortran的路径并设置code run的执行命令如果希望编译后立即执行exe,可将 “fortran...

2019-04-14 12:42:12 2821 2

原创 cp2k6.1在Ubuntu18.01中的编译安装

cp2k6.1在Ubuntu18.01中的编译安装安装准备安装方法:toolchain script 安装1 python版本2 下载安装文件3执行脚本命令生成make文件4 复制make文件/设置环境变量5 执行编译安装准备1.官方安装指南:[link] (https://www.cp2k.org/howto:compile)2.安装平台:Ubuntu18.01 ,GCC7.3,OpenM...

2019-04-03 15:37:47 3770 4

原创 ubuntu下openmpi的安装

1. 下载openmpi软件包openmpi-4.0.0.tar.gzhttps://www.open-mpi.org/software/ompi/v4.0/2. 解压文件3. 配置文件<或者查看install文件中的安装说明>./configure --prefix=/usr/local/openmpi 后缀用来选择安装目录为避免不必要的麻烦,包括co...

2019-03-22 14:05:19 8417 4

转载 GNU+Openmpi 并行编译CPMD3.15.3 (gcc/gfortran 4.4 + openmpi + atlas/fftw3)

转载自:http://hi.baidu.com/xijunw/item/1db8690fb3dfb7dd72e67686

2014-04-21 19:10:20 1742

转载 kindle paperwhite 的越狱和KOreader的安装

请查阅github上的网页https://github.com/koreader

2014-04-19 17:32:00 1223

转载 linux下各个文件夹的作用

Linux系统/目录下的文件夹里面分别是以下内容:/usr 包含所有的命令和程序库、文档和其他文件,还包括当前linux发行版的主要应用程序/var 包含正在操作的文件,还有记录文件、加密文件、临时文件等/home 除了root用户外的所有用户的配置文件,个性化文件和主目录,即家目录/proc 虚拟目录,该目录实际上指向内存而不是硬盘/bin    系统执行文件(二进制

2014-04-12 10:03:40 470

原创 安装ubuntu之后的一些设置总结(更新ing)

https://wiki.ubuntu.org.cn/1. 设置右键“在此处打开终端”sudo apt-get install nautilus-open-terminalnautilus -q 2 设置英文路径很多时候都喜欢在桌面上放一些要操作的文件,linux里命令行操作又多,难免会用命令行操作桌面上的东西,那么就要 “cd 桌面”,打“桌面”的时候要输入法切换,麻烦...

2014-04-06 22:39:47 824

原创 GNU系统下DL_POLY的编译

下载地址http://www.stfc.ac.uk/CSE/randd/ccg/software/DL_POLY/25526.aspx 下载需要注册,按照邮件中的方法进行解压  串行版本的编译 1.将build文件夹下的makefile_SLR1重命名为makefile复制到source文件夹下  2.

2014-04-06 21:16:44 1214

原创 Packmol 的安装

packmol可用于将单个分子复制扩展成多个分子构成的团簇或体系,生成用于分子模拟的.pdb ,.XYZ,.mol2等文件下载地址:http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/网站上有详细的使用方法简介安装方法1. 将下载的packmol.tar.gz 解压到  ~/packmol 下2. 执行./configure gfor

2014-04-06 15:12:18 8717

原创 VMD - VisualMolecularDynamic 的编译安装

VMD Visual Molecular Dynamic 下载地址:

2014-04-06 14:56:30 4886

原创 ubuntu 下设置系统环境变量

将脚本或可执行程序所在位置的路径加入系统默认搜索路径$PATH下,可以直接运行,而不必进入脚本或程序所在的文件夹下执行。方法 1.打开 /etc/profilesudo gedit /etc/profile 2.在profile文件最后加入脚本或可执行文件的路径,多个路径用:隔开,以packmol和VMD为例export PATH=$PATH:/h...

2014-04-06 14:47:51 2800

转载 ubuntu12.10 下安装windows字体

1. 从ubuntu下进入windows

2014-04-05 22:32:10 652

vmd-1.9.1.bin.LINUXAMD64

用于分子模拟中,分子结构和体系可视化的软件

2014-04-06

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