nnunet
Alpha收割机
这个作者很懒,什么都没留下…
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nnunet修改batchsize、patchsize
nnunet修改batchsize、patchsize本文只是为了自己平时训练方便而做的笔记,不保证一定正确,但这样修改的确能正常使用。1、首先使用官方的数据集处理命令,对数据集进行处理2、使用如下代码修改batchszie、patchsizeimport picklefrom batchgenerators.utilities.file_and_folder_operations import *import numpy as np#源plans文件的路径,基于该文件进行修改,这个保存b原创 2021-05-22 14:58:26 · 4909 阅读 · 1 评论 -
使用pytorch cuda11 cudnn8.02 Docker搭建nnUNet训练环境
使用pytorch cuda11 cudnn8.02 Docker搭建nnUNet训练环境本文目的是加速训练过程,平时使用pytorch1.6 cuda10.2训练一个epoch将近400秒,搭建好docker环境后,使用cuda11、cudnn8.0.2 的环境,一个epoch的时间只需要160秒左右。加速非常明显。问题来源于:https://github.com/MIC-DKFZ/nnUNet/issues/292项目主仓库 :https://github.com/MIC-DKFZ/nnUNet原创 2020-10-17 11:14:16 · 2356 阅读 · 2 评论 -
nnUnet如何生成自己数据集的json文件
提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档文章目录前言一、nnUnet安装二、具体步骤1.准备好你自己的数据集参考前言最近在学习nnUnet这个框架,想用在自己的数据集上,所以就github来一番,终于找到了一些简单的创建数据集的方法。一、nnUnet安装nnUNet官方地址如下:https://github.com/MIC-DKFZ/nnUNet安装可以参考如下博客:(四:2020.07.28)nnUNet最舒服的训练教程(让我的奶奶也会用nnUNet(上))(9原创 2020-10-12 21:13:24 · 5347 阅读 · 8 评论