用xjview可视化fMRI分析结果

一、下载和安装 xjview

(1)在官网下载 xjview 安装包，填写邮箱，会收到下载链接(http://www.alivelearn.net/xjview/download/);
(2)解压后将 xjview 文件夹添加到 MATLAB 搜索路径;
(3)将 xjview 文件夹中的 aal.img/hdr, brodman.img/hdr, ch2.img/hdr 和 ch2bet.img/hdr 复制到 SPM 安装目录下的 canonical 文件夹下;
(4) 在 MATLAB 命令行窗口输入 xjview 测试是否安装成功。

二、四种呈现方式

xjview 有四种呈现脑图的方式，分别为 glass, section, 3D render 和 slice 视图。
(1)点击“Or click to open an example image”， 打开 xjview 提供的一个样例数据;
(2)打开样例数据后，会在更新的窗口中呈现两种脑图，左边的是 glass 视图，右边的是 section 视图;
(3)点击窗口左下角中的“Render View”会弹出 3D 视图的窗口;

(4)点击窗口左下角中的“slice view”会弹出 slice 视图的窗口。

三、定位脑区

(1)在 section 视图中选择一个位置，在 glass/section 视图正下方会出现该位置的定位信息。通过//分隔，前 5 个是基于 Talairach 分区模板，第 6 个是基于 AAL 分区模板。

(2)点击左下角中的“Pick Cluster/Info”会在窗口中显示该位置所属团块(cluster)的大小(体素个 数)和脑区信息。


(3)点击左下角中的“Report”会在命令行窗口中显示所有团块的大小、脑区、定点坐标、极大值等信 息。

(4)点击左下角的“Volume”会显示所有团块的信息，点击某个团块的坐标，section 视图中的光标会 自动跳到该坐标的位置，即可以通过交互的方式查看团块。

四、同时显示多个文件

(1)打开文件时，同时选择多个文件即可实现多个文件重叠显示的效果。
(2)点击左下角“common region”，只显示多个文件重叠(共有)的区域。

五、其他

(1)去除 slice 视图的光标(xhair)

(2)设置颜色(colorbar)
可以通过调整 colorbar 的最大&最小值的方式来设置颜色。

(3)可以只显示正或负值
(4)调整显示的阈值

参考：http://learning-archive.org/?p=184