RS-fMRI统计分析及作图入门

获取统计图

要做统计分析需要以下数据文件

第二个检查空间变准化效果，一张一张图片打开，看配准效果好不好，肉眼可见配的不好的就可以直接排除掉。细微的差错视自己的数据要求来抉择。
第三个检查头动效果，文件夹打开之后，看文本文档“ExcluedeSubjects.txt”，里面会给出头动大于3.0， 2.5 … 的都有哪个被试
可以把以上数据分别存入case/control组里面
接下来可以用RESTplus做t检验：
打开RESTplus —— statistics analysis —— Two sample t-test —— 添加分组，一定是先导入patient，再倒入group（因为最后的结果是patient-gruop） —— 可以选mask —— compute结束，可以得到一张统计图

拿到统计图之后怎么办？

统计图实际上就是为了看一下，两组之间有差异的部分。拿到统计图之后，首先要做的是校正
GRF校正：打开Theory Correction —— 加入统计map —— 选择mask（全脑的） —— t检验选择双尾，f检验选单尾 —— p写0.001 ，也可以0.005 —— run
在matlab的窗口里面会生成如下的结果

意思是要想通过多重比较校正，团块的大小必须大于261voxels
做完多重比较校正之后，会生成以下文件，我们要用的是最后一个，已经转换为了Z值

这个nii可以用RESTplus的view来查看
如果要用这个图，可以进行美化：
点击template选择CH2，可以加上脑底板
可以取消勾选crosshair，就可以去掉两掉坐标轴
Misc里面可以 设置color bar，最小是2，最大20
Montarge可以选择显示几层
cluster size里面输入261
CI Reprot可以导出实验报告
之后再matlab命令框里面有：团块voxel大小，团块峰值点坐标，