安装开源版Pymol

1. Pymolwiki的教程

https://pymolwiki.org/index.php/Windows_Install

2. Step by Step Install Open Source Pymol 2.x in Windows by Conda

3. 自定义安装

https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/    #pymol-open-source，可下载需要的.whl文件

这个链接貌似没用了，可在Github中找到合适的 wheel

Releases · cgohlke/pymol-open-source-wheels · GitHub

或通过夸克网盘下载
链接：https://pan.quark.cn/s/e444c9497b10

conda create -n pymol python=3.7
conda install -c conda-forge pip numpy pmw
# pip install Pmw-2.0.1-py3-none-any.whl
pip install pymol-2.5.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl
# pip install pyqt5 # 美化连接窗口；通常会报错，可采用以下方式解决
pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple pyqt5		   #报错的时候，网络问题，关闭梯子

3. 报错信息

安装pyqt5时出现报错

error: Microsoft Visual C++ 14.0 or greater is required. Get it with "Microsoft C++ Build Tools": https://visualstudio.microsoft.com/visual-cpp-build-tools/

解决方法：

(1) conda install libpython m2w64-toolchain -c msys2             #解决C++依赖的问题

Microsoft Visual C++ 14.0 is required.-CSDN博客

(2) 安装Microsoft Visual C++ 2015-2022 
可以卸载一下目前电脑里所有的Microsoft Visual C++ 2015，Microsoft Visual C++ 2015-2022 ，Microsoft Visual C++ 2015-2019。然后从以下链接下载2个Microsoft Visual C++ 2015-2022 进行安装（2个都需要）
https://aka.ms/vs/17/release/vc_redist.x86.exe
https://aka.ms/vs/17/release/vc_redist.x64.exe

 如果安装Microsoft Visual C++ 2015-2022，仍然出现相同的报错信息，重启一下再试试。若重启无用，则使用pyqt5.whl安装

（3）下载pyqt5的whl安装包安装

PyQt5 · PyPI

pip install PyQt5-5.11.3-5.11.2-cp35.cp36.cp37.cp38-none-win_amd64.whl