Python 和 R 数据分析/挖掘工具互查

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数据库
类别PythonR
MySQLmysql-connector-python(官方)RMySQL
Oraclecx_OracleROracle
Redisredisrredis
MongoDBpymongoRMongo, rmongodb
neo4jpy2neoRNeo4j
Cassandracassandra-driverRJDBC
ODBCpyodbcRODBC
JDBC未知[Jython Only]RJDBC
IO类
类别PythonR
excelxlsxWriter, pandas.(from/to)_excel, openpyxlopenxlsx::read.xlsx(2), xlsx::read.xlsx(2)
csvcsv.writerread.csv(2), read.table
jsonjsonjsonlite
图片PILjpeg, png, tiff, bmp
统计类
描述性统计
类别PythonR
描述性统计汇总scipy.stats.descirbesummary
均值scipy.stats.gmean(几何平均数), scipy.stats.hmean(调和平均数), numpy.mean, numpy.nanmean, pandas.Series.meanmean
中位数numpy.median, numpy.nanmediam, pandas.Series.medianmedian
众数scipy.stats.mode, pandas.Series.mode未知
分位数numpy.percentile, numpy.nanpercentile, pandas.Series.quantilequantile
经验累积函数(ECDF)statsmodels.tools.ECDFecdf
标准差scipy.stats.std, scipy.stats.nanstd, numpy.std, pandas.Series.stdsd
方差numpy.var, pandas.Series.varvar
变异系数scipy.stats.variation未知
协方差numpy.cov, pandas.Series.covcov
(Pearson)相关系数scipy.stats.pearsonr, numpy.corrcoef, pandas.Series.corrcor
峰度scipy.stats.kurtosis, pandas.Series.kurte1071::kurtosis
偏度scipy.stats.skew, pandas.Series.skewe1071::skewness
直方图numpy.histogram, numpy.histogram2d, numpy.histogramdd未知
回归(包括统计和机器学习)
类别PythonR
普通最小二乘法回归(ols)statsmodels.ols, sklearn.linear_model.LinearRegressionlm,
广义线性回归(gls)statsmodels.glsnlme::gls, MASS::gls
分位数回归(Quantile Regress)statsmodels.QuantRegquantreg::rq
岭回归sklearn.linear_model.RidgeMASS::lm.ridge, ridge::linearRidge
LASSOsklearn.linear_model.Lassolars::lars
最小角回归sklearn.linear_modle.LassoLarslars::lars
稳健回归statsmodels.RLMMASS::rlm
假设检验
类别PythonR
t检验statsmodels.stats.ttest_ind, statsmodels.stats.ttost_ind, statsmodels.stats.ttost.paired; scipy.stats.ttest_1samp, scipy.stats.ttest_ind, scipy.stats.ttest_ind_from_stats, scipy.stats.ttest_relt.test
ks检验(检验分布)scipy.stats.kstest, scipy.stats.kstest_2sampks.test
wilcoxon(非参检验,差异检验)scipy.stats.wilcoxon, scipy.stats.mannwhitneyuwilcox.test
Shapiro-Wilk正态性检验scipy.stats.shapiroshapiro.test
Pearson相关系数检验scipy.stats.pearsonrcor.test
时间序列
类别PythonR
ARstatsmodels.ar_model.ARar
ARIMAstatsmodels.arima_model.arimaarima
VARstatsmodels.var_model.var未知
python还可参见PyFlux.
生存分析
类别PythonR
PH回归statsmodels.formula.api.phreg未知
专门分析的模块:
Python: Lifelines
机器学习类
回归
参见统计类
分类器
LDA、QDA
类别PythonR
LDAsklearn.discriminant_analysis.LinearDiscriminantAnalysisMASS::lda
QDAsklearn.discriminant_analysis.QuadraticDiscriminantAnalysisMASS::qda
SVM(支持向量机)
类别PythonR
支持向量分类器(SVC)sklearn.svm.SVCe1071::svm
非支持向量分类器(nonSVC)sklearn.svm.NuSVC未知
线性支持向量分类器(Lenear SVC)sklearn.svm.LinearSVC未知
基于临近
类别PythonR
k-临近分类器sklearn.neighbors.KNeighborsClassifier未知
半径临近分类器sklearn.neighbors.RadiusNeighborsClassifier未知
临近重心分类器(Nearest Centroid Classifier)sklearn.neighbors.NearestCentroid未知
贝叶斯
类别PythonR
朴素贝叶斯sklearn.naive_bayes.GaussianNBe1071::naiveBayes
多维贝叶斯(Multinomial Naive Bayes)sklearn.naive_bayes.MultinomialNB未知
伯努利贝叶斯(Bernoulli Naive Bayes)sklearn.naive_bayes.BernoulliNB未知
决策树
类别PythonR
决策树分类器sklearn.tree.DecisionTreeClassifiertree::tree, party::ctree
决策树回归器sklearn.tree.DecisionTreeRegressortree::tree, party::tree
Assemble方法
类别子类别Python
Bagging随机森林分类器sklearn.ensemble.RandomForestClassifier
Bagging随机森林回归器sklearn.ensemble.RandomForestRegressor
BoostingGradient Boostingxgboost模块
BoostingAdaBoostsklearn.ensemble.AdaBoostClassifier
Stacking未知未知
聚类
类别PythonR
kmeansscipy.cluster.kmeans.kmeanskmeans::kmeans
分层聚类scipy.cluster.hierarchy.fcluster(stats::)hclust
包聚类(Bagged Cluster)未知e1071::bclust
DBSCANsklearn.cluster.DBSCANdbscan::dbsan
Birchsklearn.cluster.Birch未知
K-Medoids聚类pyclust.KMedoids(可靠性未知)cluster.pam
关联规则
类别PythonR
apriori算法apriori(可靠性未知,不支持py3), PyFIM(可靠性未知,不可用pip安装)arules::apriori
FP-Growth算法fp-growth(可靠性未知,不支持py3), PyFIM(可靠性未知,不可用pip安装)未知
神经网络
类别PythonR
神经网络neurolab.net, keras.*nnet::nnet, nueralnet::nueralnet
深度学习keras.*不可靠包居多以及未知
当然,theano模块值得一提,但本质theano包的设计并非在神经网络,所以不归于此类。
概率图模型
python: PyMC3
文本、NLP
基本操作
类别PythonR
tokenizenltk.tokenize(英), jieba.tokenize(中)tau::tokenize
stemnltk.stemRTextTools::wordStem, SnowballC::wordStem
stopwordsstop_words.get_stop_wordstm::stopwords, qdap::stopwords
中文分词jieba.cut, smallseg, Yaha, finalseg, geniusjiebaR
TFIDFgensim.models.TfidfModel未知
主题模型
类别PythonR
LDAlda.LDA, gensim.models.ldamodel.LdaModeltopicmodels::LDA
LSIgensim.models.lsiModel.LsiModel未知
RPgensim.models.rpmodel.RpModel未知
HDPgensim.models.hdpmodel.HdpModel未知
值得留意的是python的新第三方模块,spaCy
与其他分析/可视化/挖掘/报表工具的交互
类别PythonR
wekapython-weka-wrapperRWeka
TableautableausdkRserve(实际是R的服务包)

 

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