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原创 高通量换原子步骤方案
解释 -i表示直接对文件进行修改,6限定了搜索范围,s搜索操作,搭配正则表达式Fe换Si, 后面的是修改的文件名字。首先是一个换原子的方案。
2023-09-17 21:23:10 48 1
原创 python-docx 页眉的处理
(这个不用管)首先Document对象没有默认的段落,但有一个默认的节。获取默认章节,并且在后面添加新章节。对于页眉的讨论先要理解节的概念。
2023-08-12 20:28:53 990 1
原创 算例03-震动频率全套
bigbro推荐了一个网址还可以 http://www.chemspider.com/Default.aspx其中可以搜索到.mol文件(操作的时候复制的时候不好复制是可能会用到Alt + shift)这里首先一个先学一下如何书写POSCAR首先写出头头此处应该再写一个移动原子的脚本(。。。。。)以后再写。
2023-07-07 20:37:50 158 1
原创 输出文件详解-待续
CONTCAR是POSCAR优化后的文件,当第一个离子步跑完的时候会开始更新,因此是实时更新的。这里有个习惯需要养成:就是每次的续算需要保存以前的一些数据。脚本名字为: save_calculations.sh。
2023-07-06 20:27:47 110 1
原创 vasp输入文件INCAR参数详解
3)对所有体系,如果想获取更加精确能量的时候用-5,但这时候如果K点数目小于3,程序则会罢工;K 点少,半导体或者绝缘体,那么只能用 ISMEAR = 0;物理含义:ISMEAR这一个参数规定的费米面附近电子是否严格的遵守费米面以上没有电子,-5含义,时候表示严格遵守费米面上没有电子,0表示有半填充的能带。4)在DOS能带计算中,使用ISMEAR= -5 用于获取精确的信息。ISMEAR=0能带是要跨越费米面的,1)不同的值对应的是不同的展宽方法;总结:金属不能用-5。
2023-07-06 13:13:28 2172 2
原创 liunx脚本-批量生成POTCAR
其中“xargs -I {}”是一个参数传递的命令。${i}是循环内部的参数传递。本脚本的难点主要在于下面这句。
2023-07-05 09:32:49 341
空空如也
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