自然微生物综述( IF:31.851)于2018年在线发表了微生物组领域的研究方法综述,不仅系统总结了过去,更为未来3-5年内本领域研究方法的选择,提供了清晰的技术路线,让大家做出更好的研究,微生物组学研究主要涉及两方面技术:测序技术和数据分析技术,随着基因测序技术的进步和测序成本不断下降,大样本量的微生物组学研究激增。传统的统计方法已经不再适用于极度高维、稀疏的微生物组数据分析,而适用于复杂数据分析的机器学习逐渐成为微生物组学数据分析的首选方法。机器学习已被证明是分析微生物群落数据并对特定结果进行预测(包括人类和环境健康)的有效方法,基于微生物群落数据的机器学习已被成功用于预测人类健康中的疾病状态、环境质量和环境中污染的存在,并可以作为法医学中的微量证据。机器学习算法已经在肠道微生物、微生物组数组表型、环境微生物、微生物生态学、皮肤微生物、土壤微生物、植物微生物、人体微生物等领域应用广泛,通过查阅文献发现近几年机器学习在微生物组研究发刊分值都很高,特别是在Nature Communications、Advanced Materials(IF=30.849)、Water Research Nature Microbiology、Environment International 、Nature Methods、Cell Regeneration、JAIMS等期刊多次发表!
代谢组学是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有代谢产物同时进行定性定量分析的学科,被广泛用于揭示小分子与生理病理效应间的关系。目前,代谢组学已经被应用于药物开发的各个阶段(如药物靶标识别、先导化合物发现、药物代谢分析、药物响应和耐药研究等)。基于代谢组学的高性价比特性,它被药学领域的研究者给予了厚望,有望加速新药开发的进程。然而,代谢组领域还面临着严重的信号处理与数据分析问题,对其在新药研发中的