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原创 报错:cmake: /usr/local/lib/libcurl.so.4: no version information available (required by cmake)

报错:cmake: /usr/local/lib/libcurl.so.4: no version information available (required by cmake)wangshuai@wangshuai-TUFx470:~$ cmakecmake: /usr/local/lib/libcurl.so.4: no version information available (r...

2018-10-20 21:46:44 13706 2

转载 安装win10和ubuntu16.04双系统(SSD,HDD双硬盘分区)

1. 我的电脑原先已经安装了win10。2. 磁盘分区,为ubuntu系统安装腾出空间(参考windows10+ubuntu 16.04+双硬盘(SSD+HDD)分区(图文)https://blog.csdn.net/tuzhenlei/article/details/52098046)SSD : 238.47GB【100.00G(win10启动)+8.00GB(OEM分区,用来一键恢复)...

2018-10-20 19:24:40 4168

转载 ubuntu16.04安装nvidia geforce gtx1080ti显卡驱动和cuda10.0用来运行gromacs-gpu

1. 走不通的方法如上图所示,我使用ubuntu自带的软件software&updates的additional drivers栏安装nvidia显卡驱动(nvidia-384,这个驱动并不是最新的驱动), 而且我没有禁用nouveau。如下所示,vmd能够检测到cuda和显卡,nvidia-smi也能检测到驱动。不过发现/usr/local/目录下并没有任何的cuda的文...

2018-10-20 14:03:26 5136 2

原创 经验笔记 : psftp使用,pscp远程拷贝

问题:ssh secure shell client这个软件不能进行文件传输了,只能登陆shell报错为:File transfer server could not be started or it exited unexpectedly.Exit value 0 was returned. Most likely the sftp-server is not in the path of...

2018-10-08 09:30:54 2908

原创 ubuntu16.04虚拟win7——经验笔记——问题:Kernel driver not installed (rc=1908) error.

ubuntu16.04虚拟win7——经验笔记——问题:Kernel driver not installed (rc=1908) error. The VirtualBox Linux kernel driver (vboxdrv) is either not loaded or there is a permission problem with /dev/vboxdrv. executing...

2018-07-05 15:39:13 6960

原创 计算生物化学中计算RMSD的方法

vmd 中计算RMSD的方法:(http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/vmd/tutorial-html/node7.html)amber中计算RMSD的方法:(http://ambermd.org/tutorials/analysis/tutorial1/)

2018-01-25 00:28:35 10980

原创 分子动力学模拟-轨迹处理-求平均结构

利用amber的cpptraj求动力学轨迹的平均结构(蛋白核酸复合物):先导入轨迹然后有下面三种叠合(align)方式1. rms first mass @所有蛋白核酸复合物的骨架原子2. rms first3. rms first mass @所有核酸骨架原子(没有蛋白的骨架原子)图中红色复合物构象(对应方法1)最扁,深蓝色的(方法2)次之,浅蓝色(方法3)的是正

2017-04-07 17:40:00 4891 1

原创 tcl脚本经验笔记

vmd读入分子动力学轨迹(dcd),输出蛋白质5埃范围内核酸分子的残基序号到一个新文件中

2017-03-24 20:44:18 625

转载 shell script 经验笔记

linux经验笔记一、sed二、AWK三、sort 命令四、shell——if五、shell——截取字符串六、shell——单引号和双引号七、grep八、简单的shell脚本九、shell 函数 自定义回收站

2017-03-04 20:42:58 489

转载 excel/word经验笔记

excel经验笔记1.如何把word中粘贴的图片和图形组合在一起 2.合并单元格并保留单元格内容3.利用函数从某列单元格中找出与目标单元格完全一致的单元格(单元格匹配)4.截取单元格内的字符5.隔行取数6.excel 多行中两列如果同时相同时如何将另一列中的数量相加7.怎么样在excel表格里面每隔一行插入一个空行8.excel 快捷键-重复上一操作

2017-02-05 12:17:52 897

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