蛋白质结构域的概念_怎么查询蛋白质的全部信息 UniProKB数据库

今天给大家介绍一个数据库：UniProKB数据库(网址http://www.uniprot.org)。这个数据库对于查询蛋白质相关信息还是很全面的。

比如我们想要查询人类p53蛋白的主要功能、结构域、翻译后的修饰和参与的代谢途径，以及与它相互作用的蛋白和疾病这些信息，打开这个网站，输入p53，点击查询。

网页左侧会显示出这个蛋白最常见的物种，我们选择物种是human的p53。

接下来，你会看到网页左侧的导航栏里，有很多你想要查到的蛋白讯息。

这里跟大家稍微介绍一下，我们经常会看到的GO分析，它到底指的是什么？GO分析的全称是Gene Ontology，它包括基因参与的生物过程，所处的细胞位置，发挥的分子功能三方面的信息，通过DAG(有向无环图)的结构表达不同的功能概念，从而较全面地概括了基因的功能信息，简单的说来，我们可以把它理解成基因的族谱和档案。

PDB数据库，蛋白质结构数据库，全称是protein data bank，主要是显示蛋白质的三级结构。

PROSITE数据库收集了生物学有显著意义的蛋白质位点和序列模式，并能根据这些位点和模式快速和可靠地鉴别一个未知功能的蛋白质序列应该属于哪一个蛋白质家族。有的情况下，某个蛋白质与已知功能蛋白质的整体序列相似性很低，但由于功能的需要保留了与功能密切相关的序列模式，这样就可能通过PROSITE的搜索找到隐含的功能motif，因此是序列分析的有效工具。PROSITE中涉及的序列模式包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、与小分子或其它蛋白质结合的区域等；除了序列模式之外，PROSITE还包括由多序列比对构建的profile，能更敏感地发现序列与profile的相似性。PROSITE的主页上提供各种相关检索服务。(来自百度百科)

进入KEGG数据库，可以查询到目的蛋白相关的所有通路。