linux64 gaussian 16,Gaussian 16 运行与硬件配置参考

本文详细介绍了Gaussian 16(A.03版)的主要更新,包括对GPU的支持、预设值的改变、输入部分和并行性能的改进。G16支持TD频率、TS优化、GPU计算和多种编程接口。在硬件配置上,建议针对大型分子和计算任务分配足够的内存,并合理使用CPU和GPU资源。对于并行计算,推荐使用SMP和Linda/Linda跨节点并行,同时强调GPU计算在DFT任务中的优势和限制。
摘要由CSDN通过智能技术生成

一. Gaussian 16的主要更新

Gaussian系列软件最新的版本为Gaussian

16(G16, 高斯16) Revision A.03, 简称G16 A.03。G16的主要更新包括:

支持TD频率、TS优化与IRC计算

非简谐振动光谱

电子振动光谱等

EOMCC优化

支持GPU计算提高性能

支持Fortran、C、Perl与Python的接口

二. 关于应用

NVIDIA GPU支持Hartree-Fock与DFT计算,性能细节参见性能部分。

提高了大量CPU并行的性能,更多细节与如何优化多CPU、集群与GPU性能参见性能部分。

link0(%)部分的输入参数与Default.Route文件的输入参数现在也可以通过命令行或环境变量来设定,更多细节可参见输入部分。

除了图形界面外与命令行界面外,还提供了Fortran,C,Perl与Python接口。

三. 关于预设值的改变(与Gaussian 09比)

在Gaussian 16里使用了不同于Gaussian 09的预设参数/值:

a. 积分精度由10^-10变为10^-12

b. DFT格点(DFT grid)由FineGrid变为UltraFine;

CPHF的预设格点由CoarseGrid变为SG1

c. SCRF预设为IEFPCM的对称形式(symmetric form, 在Gaussian

09里没有)而不是原先的非对称版本(non-symmetric)

d. 物理常数不再使用2006版的值而是使用2010版的值

e. 使用G09Defaults关键字可以将预设值设为Gaussian 09的值(与Gaussian

09兼容),但是在新的研究中强烈建议使用新的参数。

G16预设的内存为%mem=100mw。但对于更大的分子获更多的CPU核心数时,应当使用更大的值,详情参见性能部分

注:对32BIT机器而言1mw=3.81mb;对64BIT机器而言1mw=7.63mb。

TDDFT频率计算默认情况下采用解释解,比Gaussian 09的数值解速度更快。

四. 关于输入部分的改变

大部分控制Gaussian 16操作的选项有4种方式:

通过输入文件的link0输入(%-行)

通过命令行输入

通过环境变量输入

通过Default.Route文件输入

在搜索Default.Route文件时候,先搜索默认目录,再搜索Gaussian

16可执行路径的目录(环境变量GAUSS_EXEDIR, 指向$g16root/g16)。</

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