堆叠柱状图连线画法
提出问题
18年1月29日宏基因组转载了中科院生态中心邓晔组的文章《土壤细菌定量方法结合相对丰度分析揭示种群的真实变化》。其中的图3基于堆叠柱状图,添加组间各成分连线,可以更容易的观察和比较组间的变化。如下图:
我在很多文章中也见过,一直没有学会具体的做法。这回正好身边的人会做,就问了一个作者,结果回复是origin画的,有个选项就可以添加组间连线。
现在方法是有了,不过我还是喜欢用R来画图,因为每一个细节的修改都落实的代码上,可见可重复。
而窗口操作类的软件,操作过程是不容易被记录的,别人也很难重复。
我下午将此问题放在了宏基因组0讨论群中,问是否有R包或现成的函数一句话实现在堆叠图中添加组间连线。
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李陈浩老师首先説写两句R就搞定。可是以我的R水平,虽然学过R in action,还只是会按帮助使用包,修改代码的水平,很难写代码实现想法。
同时李海敏、沈伟等几位老师,也提供了众多解决方案,如ggalluvial,这个更炫酷,功能过于强大,我会在下一次分享中把中文笔记和使用心得带给大家。