caspase
家族及在细胞凋亡中的作用
注
:
本文仅是基础知识,目前这方面进展十分快,需要更新更多的知识。如
caspase
家族目前
发现至少
14
种。这里仅介绍几种常见的成员。目的是让大家了解到
caspase
家族的概况,
以及在细胞凋亡中的作用。
一
caspase
家族蛋白酶的组成
未活化的
caspase
家族蛋白酶是以酶原形式存在的,酶原的氨基端有一段被称为
“
原结构
域
”(pro
-domain)
的序列。酶原活化时不但要将原结构域切除,并且要将剩余部分剪切成一大
一小两个亚基,
分别称为
P20
和
P10
,
活性酶就是由这两种亚基以
(P20/P10)2
的形式组成的。
这种活化反应也是
Asp
特异的,剪切发生在酶原中保守序列的
Asp
与其后的氨基酸残基之
间,
一般是先切下羧基端的小亚基,
然后再从大亚基的氨基端切去原结构域。
这种剪切可以
是酶原及中间活性酶自我催化,也可以是其它
ICE
家族蛋白酶的作用,还有其它酶类如颗
粒酶
B
参与。
表
5. caspase
家族蛋白酶的识别序列及作用底物
蛋白酶名称
别名
识别序列
底物
caspase 1 ICE YV
AD pro-IL-1
, pro
-caspase 3, pro-caspase 4
caspase 4 TX, ICH-2, ICErel-II
pro-caspase 1
caspase 5 ICErel-III, TY
mICH3
mICH4
caspase 2 ICH-1
PARP
caspase 9 ICE-LAP6, Mch6
PARP
caspase 3 CPP32, Yama, apopain DEVD PARP, DNA-PK, SRE/BP, rho-GDI, KC
caspase 6 Mch2 VEID lamin A
caspase 7 Mch3, ICE-LAP3, CMH-1 DEVD PARP, pro-caspase 6
caspase 8 MACH, FLICE, Mch5 DEVD pro-caspase3,4,7,9,10
caspase 10 Mch4 YV
AD
caspase 11 ICH3, FLICE2
CED-3
已命名的
caspase
家族成员均已克隆成功,它们不但在氨基酸序列上具有同源性,而且在空
间结构上也很相似。目前已经获得了
caspase-1(ICE)
和
caspase-3(CPP32)
的
X
线结晶图像,
结果显示它们具有相似的空间结构,在
P20
的
C
端和
P10
的
N
端有
200
多个氨基酸残基的
序列尤为保守,在空间结构上组成相似的
折叠中心和相邻的
螺旋,保守的、对蛋白酶
活性有特殊意义的氨基酸残基均位于这一段,
并形成特定的结构。
不同源的序列主要存在于
P20
的
N
端和
P20
与
P10
交界处,这两个部位的氨基酸残基在蛋白酶活化过程中一般被全
部或部分切除。
所有的成员都保守性地包含有与底物
P1Asp
作用的氨基酸残基,如在
ICE
中,它们是催化
中心的
Cys285
,与酶
/
抑制剂复合物的巯基半缩醛以氢键结合的
His237
,以及可以稳定反应
中间物氧阴离子的
Gly238
。
另外,
Arg179
、
Arg341
、
Gln383
和
Ser347
形成容纳
P1Asp
的
“
口
袋
”
,
Ser339
靠近
Cys285
的巯基,以氢键结合
P1
位的酰胺。与
P2~P4
作用的氨基酸残基则