老板的任务
老板今天又给一个任务:
已知两个基因分别在各个细胞中的表达值,计算细胞中 X 基因与 Y 基因的关系。
一、趋势问题
在坐标轴上绘制不同细胞中 X,Y 基因的表达值。
利用我们幼儿园学到的知识,计算 X 基因和 Y 基因在5个细胞中的均值,标准差。
因为这些基因表达值都是来自同一个细胞,所以我们可以成对来看:
那么这样成对的表达值结果可以告诉我们哪些信息呢?
先将一个细胞的两个基因表达值连接,绘制一个点
绘制完成,我们发现,X 基因相对较低的细胞对应的 Y 基因的值也较低,两个基因出现步调一致的表达情况,那么就可以用一条线来表示:
不难看到,这条线是正斜率,代表着细胞中的 X 基因表达高,Y基因同样会表达高,同样表达低也会出现相同的情况。说明两基因具有正趋势关系
来看一个相反的情况:
上图中的线为负斜率,告诉我们细胞中的 X 基因表达高,Y基因会表达低,出现相反的表达情况。说明两基因具有负趋势关系
第三种情况是,一个基因相对另一个基因,并没有显著变化。说明两基因无趋势关系: