循环计数_北京大学工学院和江西中医药大学中西医结合癌症研究中心韩平畴教授团队开发新型人工智能软件用于识别与计数多种循环肿瘤细胞表型...

近年来,液体活检循环肿瘤细胞(CTC)的计数被报导具有良好的临床意义,能为癌症诊断、预后、复发给与指导,但是临床计数CTC与其表型仍然依赖人工计数而不能实现临床转化。因此,研发一种可以代替人工且准确的计数方法是临床上亟待解决的问题。近日,北京大学工学院和江西中医药大学中西医结合癌症研究中心韩平畴教授团队在生物医学1区杂志《Theranostics》(2019 IF: 8.579)上发表论文,报道了一种新型用于识别与计数CTC表型的人工智能软件ALICE(Automated Liquid Biopsy Cell Enumerator),有望加速循CTC在临床上的应用。

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循环肿瘤细胞是从原发肿瘤脱落进入血液循环的肿瘤细胞,其中可分为3大表型:上皮CTC(E-CTC)、间充质CTC(M-CTC)和混合CTC(H-CTC)。每种CTC表型具有不同的临床意义,因此计数所有的CTC表型将会得到关于癌症更多的信息。但是,目前已有的计数软件只针对最常见的上皮CTC,尚未有一个软件是可以计数上皮表型以外的CTC。

在此项研究中,研究人员结合了传统基于规则的形态操纵和现代机器学习方法形成新型的混合人工智能ALICE,从而在荧光图像中识别、鉴定与计数高达20种不同CTC表型。ALICE软件成功在卵巢癌与胰腺癌病人的血液中识别与计数5种不同的CTC表型,与金标准人工计数相比并没有差异且两者的计数结果有优越的同意度。除此之外,ALICE也具有检测异常、篡改与合成输入图片的功能以确保最终的分析结果准确。

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该研究利用ALICE软件在胰腺癌病人血液中发现一个新的循环混合细胞(CHC)族群。这些CHC同时间表达白细胞标记物CD45和肿瘤相关标记物(E-cadherin或vimentin),并且可以被细分为CHC-1(表达CD45和E-cadherin)和CHC-2(表达CD45、E-cadherin和vimentin)。进一步分析CHC在临床上的应用发现CHC-1是胰腺癌淋巴结转移的高特异度标记物。ALICE软件有望能在临床上代替人工计数CTC表型并推广CTC在临床上的应用,改善现有癌症病人的管理。

北京大学工学院和江西中医药大学中西医结合癌症研究中心韩平畴教授为文章的通讯作者,课题组成员郑国旋为文章的第一作者。

参考文献:

Kok Suen Cheng, Rongbin Pan,Huaping Pan, Binglin Li, Stephene Shadrack Meena, Huan Xing, Ying Jing Ng,Kaili Qin, Xuan Liao, Benson Kiprono Kosgei, Zhipeng Wang, Ray P.S. Han. ALICE:a hybrid AI paradigm with enhanced connectivity and cybersecurity for aserendipitous encounter with circulating hybrid cells. Theranostics. 2020. 10 (24):11026-11048.

原文链接:https://www.thno.org/v10p11026.htm
	
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