python计算spearman_如何在python中使用scipy计算spearman相关性？

我有一个python脚本，它从基因表达式数据生成z分数。我还希望脚本创建一个spearman相关输出。我想知道复制品之间的相互关系。所以在输出中，行和列都是复制名。在

我还没有找到任何关于如何使用scipy计算两个以上列表的spearman等级相关性的例子。我能用西皮的吗统计斯皮尔曼在一个命令中比较所有的复制？我把数据存储在一个字符串中。以下是我的一些代码：t_vals=[]

z_outline = []

z_outlines = []

header = None

for line in input_file:

line = formatLine(line)

if line.startswith("#"):

header = line

header += "\n"

z_output.write(header)

sp_output.write(header)

continue

lineList = line.split("\t")

vals = []

in_vals =[]

for item in lineList[1:]:

val = float(item)

in_vals.append(val)

vals.append(val)

median = robjects.r['mean'](robjects.FloatVector(vals))[0]

mad = robjects.r['sd'](robjects.FloatVector(vals))[0]

z_vals