设置目录_生信平台搭建（九）：目录设置

到这里，我们已经利用yum完成了基础配置，利用cpanm安装了perl模块，利用pip安装了python模块，并且安装了很多R的扩展包，可以说，已经完成了生物信息分析平台基础设施的建设，地基已经搭建完了，接下来就开始搭建框架了，也就是工作目录的设置。

配置工作目录

以前看到有段子说，桌面越乱的人越聪明，越富有创造性，很多人信以为真。其实，这句说对爱因斯坦，乔布斯，扎克伯格来说是对的，对你来说，桌面越乱说明你头脑越乱。我们必须设置清晰的目录结构才能提高工作，效率，不至于找文件手忙脚乱。
一个完成的生物数据分析平台里面主要的数据包括，生物软件，生物数据库，用户组，分析数据，项目，这些必须严格区分，例如软件和数据库是公用的，分析数据放到固定目录，便于查找和归档，每个用户单独隔离。还需要将数据盘与系统盘进行区分。

创建数据目录

我们在根目录下创建一个ifs1盘，如果有其他盘，可以挂载到目录下，为什么叫这个名字呢，其实如果你看过我之前的博文，应该已经知道了。这是因为笔者最开始工作的时候，盘符就叫这个名字，这么多年已经养成了习惯，习惯这种东西有时候很难改变。比如我们这种专一男性只喜欢一类女孩——18岁的。以字母i开头可以与系统其它盘符区分开，可以一步补齐，fs代表file system，数字1表示第一块盘，后面在加其他盘，可以命名为ifs2，ifs3等，也非常方便。当然，你可以随便起名字。

#根目录下创建一个ifs1目录
mkdir /ifs1
cd /ifs1
#在ifs1下在创建其它几个目录
mkdir Software  Database  User  Project 

软件目录

软件目录是生物信息分析平台中非常重要的一个目录，最好不要将软件直接安装到/usr这样系统目录下，不方便管理，也不要在软件目录下直接运行程序。软件目录可以分为三部分，原始软件包src目录，软件安装目录biosoft，可执行程序快捷方式目录。我们在Software里面直接创建这三个目录。

mkdir -p /ifs1/Software/src  /ifs1/Software/biosoft  /ifs1/Software/bin

最后我们来看一下整体目录结构

$ tree -L 2 ifs1/
ifs1/    #数据盘
|-- Database   #生物数据库 
|-- Project    #测序数据
|-- Software   #生物软件
|   |-- bin          #可执行程序
|   |-- biosoft        #安装软件
|   `-- src        #原始数据
`-- User        #用户目录

7 directories, 0 files

---------- END ----------

(添加作者微信，请注明单位姓名)

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