费舍尔精确检验matlab,Fisher精确检验

最新推荐文章于 2024-09-28 12:14:28 发布
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本文介绍了一种高效的Fisher精确检验实现方法，该方法特别适用于基因组范围内的关联研究等大规模问题，能够以每秒250万次的速度进行单侧或双侧检验，并已验证其在样本数量达到100时的准确性。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

Fisher’s Exact Test

Matlab's implementation of Fisher's exact test only supports one-tailed tests. Other implementations on the file exchange are reportedly buggy and are far too slow for problems I'm working on. This implementation does 2.5e6 one or two-tailed tests per second and is ideally suited for genome-wide association studies or other large problems where 100s of samples and 10s to 100s of 1000s of tests are being performed.

It has been verified correct for samples sizes up to 100 and spot checked beyond that up to 1000s of samples.

無酒
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matlab fisher检验,FISHER线性判别MATLAB实现.doc
weixin_30343429的博客
03-20 1515
FISHER线性判别MATLAB实现Fisher线性判别上机实验报告班级：学号：姓名：算法描述Fisher线性判别分析的基本思想：选择一个投影方向(线性变换，线性组合)，将高维问题降低到一维问题来解决，同时变换后的一维数据满足每一类内部的样本尽可能聚集在一起，不同类的样本相隔尽可能地远。Fisher线性判别分析，就是通过给定的训练数据，确定投影方向W和阈值w0， 即确定线性判别函数，然后根据这个...
Fisherextest:Fisher 精确概率检验。-matlab开发
06-01
此文件对根据两个分类变量交叉分类的频率数据表执行 Fisher 精确概率检验，每个分类变量有两个级别或子类别 (2x2)。 它是一种非参数统计检验，用于确定两个分类变量之间是否存在非随机关联。 Fisher 精确检验用于计算具有少量预期频率的精确 P 值，卡方检验不适用于这种情况（如果观察总数小于 20 或频率单元数小于5）。 该测试基于超几何概率。 著名的罗纳德·艾尔默·费舍尔 (Ronald Aylmer Fisher) 的著作《研究工作者的统计方法》(Statistical Methods for Research Workers) 于 1934 年版中提出了该测试。 需要输入四个频率单元。 输出由负值、正值和两个 P 值组成。 [在收集（或查看）数据之前决定使用 Left、Right 或 2-Tail]。 如果用户没有输入任何输出参数，文件将返回一个 P 值表。
费舍尔精确检验matlab,基于Matlab的信号平稳性检验系统
weixin_34803466的博客
03-17 500
信号的平稳性检验在随机信号处理中起着十分基础的作用。由于平稳信号和非平稳信号的性质差别显著，因此在处理信号之前先行判断它的平稳性就显得尤为重要。虽然信号平稳性的定义十分明确，但是实际判断过程却是复杂的，例如观察尺度对信号平稳性判断就有很大的影响。这一领域的研究已经取得了一定的成果。一些人提出了受限和带参数的非平稳性判定方法，而另一些人则将他们的平稳性判定建立在对原始数据的一些假设上。而对于更一般信...
MATLAB中基于MidpMethod的Fisher精确检验实现
weixin_42577243的博客
09-28 1032
本文还有配套的精品资源，点击获取 简介：该项目专注于统计分析中的2x2列联表分析，运用Fisher的精确检验和MID-P方法来评估表格行与列的独立性。Fisher精确检验用于判断分类变量间的关联性，并提供准确的P值，尤其适用于样本量较小或期望频数低的情况。MID-P方法是Fisher检验的改进，提供更为保守的统计推断，减少假阳性错误。在MATLAB环境下，用户通过调用 ...
matlab fisher检验,模式识别中Fisher分类器的Matlab实现及测试
weixin_35924003的博客
03-20 708
模式识别中Fisher分类器的Matlab实现及测试Fisher分类器用于解决二类线性可分问题。Fisher准则基本原理：找到一个最合适的投影轴，使两类样本在该轴上投影之间的距离尽可能远，而每一类样本的投影尽可能紧凑，从而使分类效果为最佳。例如上图中：通过将方块点和圆点向w1投影，然后再在设置合适的阈值即可将方块和圆点分离。Matlab程序如下：%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%...
MyFisher:任何 RxC 矩阵的 Fisher 精确和条件检验的确定函数-matlab开发
05-29
RxC 矩阵的 Fisher 精确概率检验。 Fisher 精确检验允许在以下情况下计算精确概率，因为小区频率较小，因此更快的正态近似和卡方计算可能不准确。 Fisher 精确检验涉及计算多个阶乘以获得观察到的和每个更极端的表的概率。 阶乘增长很快，因此有必要使用阶乘的对数。 这个计算在 Matlab 中非常容易，因为：x!=gamma(x+1) 和 log(x!)=gammaln(x+1)。 此外，当矩阵有很多行和列时，计算所有可能的矩阵集非常耗时。 此函数使用此策略： 如果输入是 2x2、2x3、2x4 或 3x3 矩阵，则它使用（或下载）ad hoc，以前由我编写，函数； 否则它使用蒙特卡罗方法。 最后，这个函数使用了 Peter J. Acklam rldecode 函数，所以我想感谢他。 由朱塞佩卡迪罗创建giuseppe.cardillo-edta@poste.it 要
费舍尔精确检验或超几何分布的对数 P 值的快速算法：可应用于相对非常大的数字 (Total<100000)-matlab开发
05-30
示例：从整个基因组中识别出 30 个基因的列表后20000个基因，与周期相关的基因有5个，总共有200个基因组中的细胞周期基因，那么... 那么对数 p 值将是： % ln_p=log_fisher_test(5,25,195,19775) 或者，在基于 10 的
快速算法实现费舍尔精确检验与超几何分布对数P值计算
资源摘要信息:"费舍尔精确检验或超几何分布的对数 P 值的快速算法：可应用于相对非常大的数字 (Total)-matlab开发" 费舍尔精确检验（Fisher's Exact Test）和超几何分布是统计学中用于处理无重复抽样问题的两种方法...
MATLAB实现Fisher精确概率检验方法
在Matlab中实现Fisher精确检验，需要编写相应的函数或脚本，输入必须是四个频率单元的数据，这些数据必须是用户提前收集或计算好的。在输入这些数据后，Matlab程序将计算得出一个负值、一个正值和两个P值。这些P值是...
MATLAB实现任意矩阵的Fisher精确检验功能
Fisher精确检验是一种非参数统计检验方法，由英国统计学家罗纳德·艾尔默·费舍尔（Ronald Aylmer Fisher）提出。它主要用于2x2列联表分析，即当样本量较小，不能满足卡方检验的连续性校正或者期望频数较低时，用来...
基于matlab的Fisher判别
01-07
基于matlab的Fisher判别，Fisher判别是找一条线把高维映射为一维在进行判别的方法。
MyFisher33:在 3x3 矩阵上计算 Fisher 精确检验的非常紧凑的例程-matlab开发
05-31
Fisher 对 3x3 列联表的精确检验允许在以下情况下计算精确概率：由于小区频率小，更快速的正态近似和卡方计算可能不准确。 Fisher 精确检验涉及计算多个阶乘以获得观察到的和每个更极端的表的概率。 阶乘增长很快，因此有必要使用阶乘的对数。 在 Matlab 中，这很容易使用 Gammaln 函数。 该函数使用预分配和矢量化来加速计算。 实际上，该函数还计算中 P 校正以使测试不那么保守。
Fisher线性判别实验matlab代码
06-12
Fisher线性判别实验，.m文件，各行代码功能备注明确，有利于学习，matlab直接运行，数据更改即可用于其他类别实验分析。
Fisher线性判断之matlab实现
weixin_42465397的博客
11-24 5371
关于先行判断和Fisher变换的理论知识，这里推荐一个非常好的博客：https://blog.csdn.net/eternity1118_/article/details/51248471 在了解了理论后，知道只要求出w与w0就可以，而且已经可以根据公式求出，所以实现起来也比较简单。但这种方式只适用于线性可分，对于线性不可分，可以考虑用最小均方误差法。话不多说，下面看实现代码： %% fis...
请给出利用matlab进行Fisher判别的代码
weixin_35755188的博客
02-18 787
下面是使用Matlab实现Fisher判别的示例代码：% 设置参数：N1 = 100; % 类1中样本的数量 N2 = 100; % 类2中样本的数量mu1 = [0, 0]; % 类1的均值向量 sigma1 = [1, 0; 0, 1]; % 类1的协方差矩阵mu2 = [3, 3]; % 类2的均值向量 sigma2 = [1, 0; 0, 1]; % 类2的协方差矩阵% 生成样本：x1 =...
知识小结------数据分析------Fisher‘s exact test(费希尔检测)
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闲看庭前雪的博客
12-31 1万+
系列知识小结目录 Cox比例风险回归模型（proportional hazards model） Fisher's exact test费希尔检测系列知识小结目录前言一、Fisher's exact test费希尔检测是什么？二、原理与公式1.适用范围和目的2.公式的应用1.进行假设2.运用公式求概率P值3.评估总结 前言 这里记录了我在学习过程学到的一些统计学知识 有哪些不对的地方，希望大家能够多多批评和指正。 资料大部分来自维基百科，部分是我个人的理解。 一、Fisher’s exact te
方差分析/卡方/fisher精确检验
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3、各总体方差相等,即方差齐。（方差不齐，用非参数检验）1、各样本须是相互独立的随机样本;2、各样本来自正态分布总体;
Fisher's exact test( 费希尔精确检验)
weixin_34043301的博客
11-24 4721
Fisher's exact test[1][2][3] is a statistical significance test used in the analysis ofcontingency tables. Although in practice it is employed when sample sizes are small, it is valid for all sample s...
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