基因突变导致细胞癌变,人们自然会下意识地认为这些基因突变来自癌细胞;然而,最近,纪念斯隆·凯特琳癌症中心(MSKCC)和GRAIL联合研究团队在《Nature Medicine》发表一项研究结果发现却让人大跌眼镜:肿瘤患者血液cfDNA中携带的大部分基因突变,可能不是来自于癌细胞,而是血液中白细胞。这一令无数人惊掉下巴的研究,引发了医学界人士微信朋友圈的强级地震,文章疯转,引发了肿瘤基因检测行业的深思[1]。
《Nature Medicine》的文章证明了ctDNA检测能够很好地克服肿瘤组织的空间异质性,可以检测到肿瘤基因组的大部分突变,反映肿瘤患者的基因突变特征、TMB和MSI,以及亚克隆突变;同一个肿瘤患者的cfDNA检测和组织检测的结果可能不一致,究其原因,除了肿瘤空间异质性外,克隆性造血的突变也是一大“元凶”,导致ctDNA检测的假阳性[1]。
图1. 液体活检ctDNA检测克服肿瘤组织的空间异质性[1]
注:图A-不同癌种ctDNA检测基因组变化情况
图B-ctDNA TMB和组织TMB以及突变的一致性和异质性
具体来说,这个科学研究利用大panel(509 gene panel)和超高深度测序(60,000×)检测ctDNA和配对的白细胞,让人瑟瑟发抖;克隆性造血的问题一直存在,对于ctDNA检测真的需要配以高深度白细胞测序吗?
克隆性造血突变真面目及其影响因素?克隆性造血的突变(Clonal Hematopoiesis Mutations,CH-Mutations)是造血干细胞(Hematopoietic Stem Cells,HSCs)携带的突变,是衰老机制和外在环境选择性压力(吸烟、化疗等)阳性筛选共同作用的结果,是多种血液系统疾病发生的病理基础,在实体瘤中也会出现。在实体瘤中,克隆性造血的突变与年龄显著