imagej旋转图片_老司机带你解锁ImageJ三维图片分析技巧

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ImageJ (https://imagej.nih.gov/ij/)是美国National Institutes of Health (NIH)开发的基于Java的免费公共图像处理软件，在生物及医学图像分析中起着非常重要的作用。

ImageJ可在一个窗口中显示多个空间或时间相关的图像，这些图像集称为图像栈(Stack)，组成Stack的图像称为Slice。Stack图像是SCI论文中常用的图像类型：

今天半夏给大家分享Stack图形的概念、基本操作与实际应用。

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Stack图像介绍

数字图像不仅是二维图片或具有多个通道的二维图片，Stack图片具备有三个空间维度：X，Y和Z。

Hyperstacks具有四个以上维度，例如X(长)，Y(宽)，Z(片)，C(通道)和t(时间帧)。

下图为ImageJ官网示例Stack图片t1-head.tiff，2维图像(XY视图)窗口如左侧窗口(256 x256)，当前Slice为129张图片的第58张。t1-head.tiff图片属性如右图所示：

共聚焦图片Z-Stack层扫可以得到Stack或Hyperstacks图片，下图为共聚焦系列图片，该图片包含红、绿两通道以及Z轴25张切片：

图片属性可通过Image -> Properties得到：

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如何显示Stack图片中的所有切片？

Make Montage可以得到一个单一图片，该图片包含Stack图片中的所有图像，步骤为：

Image -> Stacks -> Make Montage。Make Montage命令窗口可以通过Columns与Ro