ubuntu保存_Arch与Ubuntu安装软件对比

本文以biom软件为例，对比一下Arch与Ubuntu软件安装的不同，尽管只以这一个软件对比不具有代表性，不过根据我使用Arch和Ubuntu安装软件的经验来说，Arch的包管理确实优秀些，快是一方面，依赖处理的也很好，软件还丰富。

biom格式文件是生物观测矩阵——微生物组数据通用数据格式，biom软件就是专门处理该文件的工具。BIOM格式是微生物组领域最常用的结果保存格式，优点是可将OTU或Feature表、样本属性、物种信息等多个表保存于同一个文件中，且格式统一，体积更小巧，目前被微生物组领域几乎所有主流软件所支持。本文不是介绍biom工具怎么使用的，只是对比Arch和Ubuntu安装该软件，关于biom格式和工具的使用，参考该文[https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/84678543]。

下面开始正式对比，先说Ubuntu安装biom软件，然后是Arch安装biom软件。biom也可以通过conda或pip安装，没有权限的不可以使用系统的包管理器安装。

Ubuntu安装biom

Ubuntu是20.04长期支持版，终端输入biom会提醒你安装python3-biom-format，然后我们sudo apt install python3-biom-format安装，会让安装不少依赖，可能是因为Ubuntu是新安装的，还没有安装什么软件，才会要安装如此多的依赖。

可是我们安装好后却不能用，报错了，如上图所示经过几次尝试，发现是缺少依赖，需要安装h5py，然后我们看官方仓库有没有该模块。

apt search h5py成功找到该模块，那么接着安装，又安装了许多依赖，然后就可以使用了。

总结就是当你输入不存在的命令时，Ubuntu会告诉你需要安装什么，这点很好，一般依赖也处理的没问题，不过这次翻车了，没有将依赖一次性安装，需要自己去发现依赖再次安装。

Arch安装biom

Arch是最新版，毕竟是滚动发行版，只要我打开Arch就会使用yay更新，yay查找、安装、卸载软件很方便。Arch使用过后就不怎么回得去Ubuntu了，所以Arch已经安装了很多软件和包，安装biom时直接yay biom，然后选择合适的安装，安装的依赖很少，可能是有些依赖包之前安装了。

安装的截图没有，不过可以根据删除的依赖发现，依赖还是很少的。安装后直接可以使用，没有出现Ubuntu那样依赖不完整的情况。

关于Arch和Ubuntu的选择

最后我们说说关于Arch和Ubuntu的选择，Ubuntu比较Linux适合新手，Arch比较适合有一定使用经验的Linux用户，起码安装来说，Arch全命令行安装，Ubuntu点几下鼠标就好了;稳定选Ubuntu或者Ubuntu的上游发行版debian或者Arch的衍生版manjaro，当然并不是说Arch不稳定，一劳永逸、简单、使用新版软件和系统选择Arch。

字里行间都能感受到我的选择哈。