EST:表达序列标签,expressed sequence tags 。
顾名思义,很好理解,就是表达出来的序列,即从基因组DNA上表达出来的RNA,但是我们没法测序RNA,所以我们最终测的是表达序列的cDNA片段。
“标签”:就是指这些序列可能比较短,但是可以用来标定一个物种。
常见下载方式有两种:
1. NCBI Web下载
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/
打开,搜索你要的物种,比如 Camellia ,可以看到结果EST (50287)。
Web下载几个还行,想要批量下载就有点费力了,ncbi反爬虫,也不好爬。
2. NCBI ftp下载
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/repository/dbEST/
直接wget就可以批量下载了。