文章原址: http://www.tuanjuwang.com/post/fa475142-3848-3a96-5fcb-e73102544d60.html
注意,本方法要使用到perl。
连接:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/PowerTools/eutils/ebot/ebot.cgi
这是一个NCBI提供的自动生成perl代码的程序。
1.在这里填上你的Email地址
2.3.在这里选择你是用keyword还是ID来进行检索
4.检索的数据库
我选择了用keyword来检索核算数据库,在5的位置填上你要检索的东西,比如我要下载小麦的全部序列,我就在这里填上小麦的物种代号
6.这里选择你要获取的数据的多少
在这一页选择输出的方式,我是需要全部的记录,所以选择Download full records(efetch)
看自己的需要选择咯
接下来在7这里填上输出结果的文件名,可以不带后缀,因为8的选项是决定你的文件格式的,后缀可以自己改的,txt,fa,seq,看自己喜好。8这里选你要的文件格式,我就用常用的FASTA格式了
最后就是在这里输入你的perl 程序的名字就好,win下边,默认后缀是.pl,填完后点生成perl,浏览器会自动下载一个perl代码,然后运行这个代码,然后等。。。。。在然后就好了。
需要注意一点的是,在最开始2的位置选择ID获取的话,保存有ID的文件,要和最后生成的代码放在同一个文件夹下边。
如果选ID的话,在这个页面输入你的保存有ID的文件名,一行一个ID就好了。
这是下载 下来的pl代码和用pl代码下载下来的序列。pl代码执行过程中,电脑可以休眠的哟。