什么是Galaxy
很多公司开始推广他们的可视化生信分析工具,有人说未来的趋势是无代码,分析只要拖拖点点就行了。无代码只能说是一个噱头,毕竟人人都会“用"excel,也不是人人都是数据分析师。
但是一个数据分析师肯定知道如何正确的使用excel,所以一个真正的生信媛/猿也不会嫌弃那些可视化的工具。毕竟写代码累了,没事拖拖点点也是别样的乐趣。
Galaxy就是很多年前在云计算背景下诞生的开源项目, 目前在GitHub上有362个star,165个贡献者。
官方站点: https://usegalaxy.org/,如果感兴趣的话可以在云端玩耍下。
![img_b5209a2f5d2b83239168febb9c84614b.png](https://yqfile.alicdn.com/img_b5209a2f5d2b83239168febb9c84614b.png)
Galaxy
然后,将有一波galaxy学习笔记更新而来。
安装
在正式安装之前,确保自己使用的是Unix/Linux系统,并且安装了Python,且版本是2.7.(最好还有Git)。
galaxy的安装非常简单,就是从github上克隆一份到本地,然后运行部署脚本,然后等着。
# 我习惯把软件安装在biosoft下
cd ~/biosoft
# 克隆到本地
git clone -b release_17.09 https://github.com/galaxyproject/galaxy.git
cd galaxy
# 修改配置文件
cp config/galaxy.ini.sample config/galaxy.ini
# The port on which to listen.
port = 1024
# The address on which to listen. By default, only listen to localhost (Galaxy
# will not be accessible over the network). Use '0.0.0.0' to listen on all
# available network interfaces.
host = 0.0.0.0
# 运行
sh run.sh
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