从零开始入门Galaxy生信云平台（2024-03版）

Galaxy是一个在线的生物信息云平台，目前已经上线了1300+生信实用工具，整合的一键式分析流程也在陆续上线中。这些工具/流程涵盖生物信息数据分析的方方面面，包括但不限于：

• 基因组数据分析

• 转录组数据分析（Bulk RNA-seq， Single Cell RNA-seq）

• 蛋白质组数据分析

• 癌症基因组测序研究

• 统计学 / 机器学习

• 生信绘图

Galaxy能够进行生物信息学上下游全链条的数据分析，它可以服务于：

• 学生，学习生物信息学；

• 教师，讲授生物信息学；

• 科研人员，快速进行数据分析，无需繁琐的工具安装和流程搭建，把精力放到生物学意义的挖掘上。

如何开始使用Galaxy？本文将介绍Galaxy中的关键任务：上传文件、使用工具、查看历史记录以及运行工作流程。

Galaxy的外观

1. 打开任意浏览器（推荐Chrome）

2. 输入网址：usegalaxy.cn

3. 注册 & 登录

Galaxy主页分为四个面板，从左到右为：

• 活动栏

• 工具面板

• 视图面板

• 历史面板

首次使用Galaxy时，历史面板中不会有文件。

关键操作

命名历史面板

1. 来到右侧的历史面板

2. 点击(Edit)

3. 输入一个新的名称，如：Learn To Use Galaxy

4. 点击保存

• 如果无法重命名，可能你没有登录，请登录后重试。

上传文件

工具位于左侧的面板中。

1. 在工具面板的上方，点击Upload Data

这将打开一个界面。

1. 点击 粘贴数据或链接

2. 粘贴一个文件地址：

   https://zenodo.org/record/582600/files/mutant_R1.fastq